16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1007 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_1007  hypothetical protein  100 
 
 
519 aa  964    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.299981  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4388  hypothetical protein  41.18 
 
 
329 aa  69.3  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8481  hypothetical protein  44.74 
 
 
386 aa  66.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0728  hypothetical protein  45.57 
 
 
209 aa  65.9  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4632  hypothetical protein  38.75 
 
 
193 aa  58.5  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.242724  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31490  hypothetical protein  35.38 
 
 
186 aa  57  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.265456  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0470  hypothetical protein  44.44 
 
 
226 aa  55.5  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11131  hypothetical protein  36.71 
 
 
212 aa  53.9  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2078  hypothetical protein  38.96 
 
 
201 aa  53.5  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0179834  normal  0.111203 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0120  hypothetical protein  40 
 
 
284 aa  49.3  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4106  hypothetical protein  36.36 
 
 
184 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4182  hypothetical protein  36.36 
 
 
184 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.126083  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4337  hypothetical protein  36.36 
 
 
184 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.159119 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1090  hypothetical protein  45.16 
 
 
231 aa  48.1  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.224449  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3115  hypothetical protein  46.81 
 
 
205 aa  48.1  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0571387  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1679  hypothetical protein  38.96 
 
 
229 aa  45.4  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>