17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4388 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4388  hypothetical protein  100 
 
 		 329 aa  629  1e-179  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0728  hypothetical protein  49.5 
 
 		 209 aa  92.4  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31490  hypothetical protein  45.57 
 
 		 186 aa  76.3  0.0000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.265456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1007  hypothetical protein  41.18 
 
 		 519 aa  69.7  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.299981  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1679  hypothetical protein  41.98 
 
 		 229 aa  68.9  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4632  hypothetical protein  42.68 
 
 		 193 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.242724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0470  hypothetical protein  38.18 
 
 		 226 aa  63.9  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2078  hypothetical protein  42.5 
 
 		 201 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0179834  normal  0.111203 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4106  hypothetical protein  36.25 
 
 		 184 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4337  hypothetical protein  36.25 
 
 		 184 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.159119 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4182  hypothetical protein  36.25 
 
 		 184 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.126083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11131  hypothetical protein  57.78 
 
 		 212 aa  53.1  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3115  hypothetical protein  55.56 
 
 		 205 aa  52.8  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0571387  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0120  hypothetical protein  41.82 
 
 		 284 aa  52.4  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8481  hypothetical protein  35.44 
 
 		 386 aa  50.1  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  30.67 
 
 		 2449 aa  44.3  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1090  hypothetical protein  42.31 
 
 		 231 aa  43.5  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.224449  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>