19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0728 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0728  hypothetical protein  100 
 
 
209 aa  405  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31490  hypothetical protein  46.3 
 
 
186 aa  171  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.265456  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1679  hypothetical protein  36.16 
 
 
229 aa  116  3e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4106  hypothetical protein  36.59 
 
 
184 aa  99.8  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4182  hypothetical protein  36.59 
 
 
184 aa  99.8  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.126083  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4337  hypothetical protein  36.59 
 
 
184 aa  98.6  5e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.159119 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2078  hypothetical protein  36.54 
 
 
201 aa  96.7  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0179834  normal  0.111203 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4388  hypothetical protein  49.5 
 
 
329 aa  94.4  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11131  hypothetical protein  35.05 
 
 
212 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4632  hypothetical protein  36.45 
 
 
193 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.242724  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3115  hypothetical protein  35 
 
 
205 aa  80.5  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0571387  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1007  hypothetical protein  45.57 
 
 
519 aa  67.8  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.299981  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0470  hypothetical protein  45.21 
 
 
226 aa  61.2  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3066  hypothetical protein  47.27 
 
 
216 aa  59.7  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.704326 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0120  hypothetical protein  48.08 
 
 
284 aa  57.8  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1090  hypothetical protein  32.03 
 
 
231 aa  56.2  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.224449  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3419  hypothetical protein  40.38 
 
 
120 aa  42.7  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.352762  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8481  hypothetical protein  35.85 
 
 
386 aa  42.4  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16840  hypothetical protein  40.38 
 
 
116 aa  41.6  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.505478  normal  0.321464 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>