17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3066 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_3066  hypothetical protein  100 
 
 
216 aa  407  1e-113  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.704326 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8481  hypothetical protein  45.45 
 
 
386 aa  80.9  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1090  hypothetical protein  35.34 
 
 
231 aa  81.3  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.224449  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0470  hypothetical protein  46.53 
 
 
226 aa  75.9  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0728  hypothetical protein  46.88 
 
 
209 aa  61.6  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31490  hypothetical protein  41.76 
 
 
186 aa  59.3  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.265456  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0120  hypothetical protein  49.02 
 
 
284 aa  58.9  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1679  hypothetical protein  26.85 
 
 
229 aa  50.4  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3419  hypothetical protein  41.51 
 
 
120 aa  48.5  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.352762  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  35.78 
 
 
2449 aa  47.4  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1364  hypothetical protein  35.71 
 
 
118 aa  45.4  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.0092194  normal  0.531836 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4388  hypothetical protein  33.61 
 
 
329 aa  44.7  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  31.58 
 
 
1888 aa  44.3  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22390  hypothetical protein  38.89 
 
 
114 aa  43.1  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3150  hypothetical protein  38.89 
 
 
78 aa  43.5  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0235475  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16840  hypothetical protein  35.85 
 
 
116 aa  41.6  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.505478  normal  0.321464 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4312  hypothetical protein  36.73 
 
 
99 aa  41.6  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>