19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_16840 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_16840  hypothetical protein  100 
 
 		 116 aa  232  2.0000000000000002e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.505478  normal  0.321464 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1754  hypothetical protein  51.35 
 
 		 117 aa  99  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1364  hypothetical protein  46.67 
 
 		 118 aa  93.2  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.0092194  normal  0.531836 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22390  hypothetical protein  49.57 
 
 		 114 aa  90.1  8e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3419  hypothetical protein  42.99 
 
 		 120 aa  77.8  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.352762  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0195  hypothetical protein  44.55 
 
 		 111 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.760426 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3736  hypothetical protein  38.94 
 
 		 111 aa  68.6  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.139071  hitchhiker  0.0052659 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3150  hypothetical protein  50.79 
 
 		 78 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0235475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0470  hypothetical protein  41.07 
 
 		 226 aa  50.8  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31490  hypothetical protein  44.44 
 
 		 186 aa  50.4  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.265456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3783  hypothetical protein  39.34 
 
 		 69 aa  49.7  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00138484  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0792  hypothetical protein  42.86 
 
 		 71 aa  48.5  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1090  hypothetical protein  40 
 
 		 231 aa  44.7  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.224449  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5788  hypothetical protein  37.93 
 
 		 329 aa  43.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0120  hypothetical protein  33.33 
 
 		 284 aa  43.5  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0728  hypothetical protein  40.38 
 
 		 209 aa  41.2  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1679  hypothetical protein  36.96 
 
 		 229 aa  40.8  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4312  hypothetical protein  34.55 
 
 		 99 aa  40.8  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3115  hypothetical protein  40.43 
 
 		 205 aa  40.4  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0571387  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>