18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1754 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1754  hypothetical protein  100 
 
 
117 aa  229  1e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1364  hypothetical protein  58.65 
 
 
118 aa  119  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.0092194  normal  0.531836 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16840  hypothetical protein  51.35 
 
 
116 aa  110  9e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.505478  normal  0.321464 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22390  hypothetical protein  48.21 
 
 
114 aa  85.9  1e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3419  hypothetical protein  46.73 
 
 
120 aa  85.9  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.352762  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3736  hypothetical protein  44.44 
 
 
111 aa  83.2  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.139071  hitchhiker  0.0052659 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0195  hypothetical protein  45.37 
 
 
111 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.760426 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3150  hypothetical protein  48.61 
 
 
78 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0235475  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4312  hypothetical protein  50 
 
 
99 aa  58.9  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0792  hypothetical protein  43.1 
 
 
71 aa  51.2  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3783  hypothetical protein  43.33 
 
 
69 aa  50.8  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00138484  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0120  hypothetical protein  41.07 
 
 
284 aa  49.7  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0470  hypothetical protein  41.51 
 
 
226 aa  48.5  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1090  hypothetical protein  42.59 
 
 
231 aa  44.7  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.224449  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4388  hypothetical protein  37.29 
 
 
329 aa  43.9  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8481  hypothetical protein  34.62 
 
 
386 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1007  hypothetical protein  36.73 
 
 
519 aa  41.2  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.299981  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3115  hypothetical protein  38.3 
 
 
205 aa  40.8  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0571387  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>