26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3335 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3335  hypothetical protein  100 
 
 
169 aa  320  5e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.382875  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2112  hypothetical protein  45.99 
 
 
149 aa  103  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.726082 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7752  hypothetical protein  43.97 
 
 
135 aa  94.7  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0552681  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1056  hypothetical protein  47.58 
 
 
181 aa  92.4  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0207319  normal  0.0395245 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3970  hypothetical protein  45.59 
 
 
150 aa  79.7  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5839  hypothetical protein  39.13 
 
 
146 aa  69.3  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.30575  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4044  hypothetical protein  34.25 
 
 
161 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.111666  normal  0.819815 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3195  hypothetical protein  40.43 
 
 
143 aa  67.4  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.207149  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1365  hypothetical protein  35.51 
 
 
149 aa  64.3  0.0000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.916958  normal  0.424206 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0773  hypothetical protein  38.06 
 
 
151 aa  61.6  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.487481  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12859  hypothetical protein  34.81 
 
 
162 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1416  hypothetical protein  32.85 
 
 
145 aa  60.5  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.214441  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1439  hypothetical protein  53.97 
 
 
368 aa  57.4  0.00000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.667254 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2148  hypothetical protein  35.29 
 
 
145 aa  56.6  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.230881  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2309  hypothetical protein  33.33 
 
 
156 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00784317  normal  0.068211 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14530  hypothetical protein  34.75 
 
 
323 aa  55.5  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.219653  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3597  hypothetical protein  35.38 
 
 
150 aa  55.1  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1322  hypothetical protein  32.79 
 
 
149 aa  53.1  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0798716 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2201  hypothetical protein  37.14 
 
 
143 aa  52  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000537964  decreased coverage  0.000461392 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2060  hypothetical protein  33.33 
 
 
156 aa  44.7  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.725411  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2123  hypothetical protein  33.33 
 
 
156 aa  44.7  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.126348  normal  0.0224154 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2077  hypothetical protein  33.33 
 
 
156 aa  44.7  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.149819  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1649  hypothetical protein  28.67 
 
 
206 aa  42.4  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.108582  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6381  hypothetical protein  31.25 
 
 
189 aa  41.2  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3389  hypothetical protein  29.29 
 
 
190 aa  41.2  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.133287  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1710  hypothetical protein  36.96 
 
 
144 aa  40.8  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.335211  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>