22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3970 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_3970  hypothetical protein  100 
 
 
150 aa  278  2e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4044  hypothetical protein  44.44 
 
 
161 aa  100  9e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.111666  normal  0.819815 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1322  hypothetical protein  43.9 
 
 
149 aa  84.3  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0798716 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2309  hypothetical protein  40.74 
 
 
156 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00784317  normal  0.068211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2112  hypothetical protein  40 
 
 
149 aa  81.6  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.726082 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12859  hypothetical protein  38.73 
 
 
162 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2077  hypothetical protein  41.91 
 
 
156 aa  77.8  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.149819  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2123  hypothetical protein  41.91 
 
 
156 aa  77.8  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.126348  normal  0.0224154 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2060  hypothetical protein  41.91 
 
 
156 aa  77.8  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.725411  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1365  hypothetical protein  43.08 
 
 
149 aa  77.4  0.00000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.916958  normal  0.424206 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7752  hypothetical protein  38.69 
 
 
135 aa  76.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0552681  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14530  hypothetical protein  37.78 
 
 
323 aa  73.6  0.0000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.219653  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5839  hypothetical protein  39.53 
 
 
146 aa  72.8  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.30575  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2148  hypothetical protein  37.14 
 
 
145 aa  70.5  0.000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.230881  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1056  hypothetical protein  40.32 
 
 
181 aa  69.3  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0207319  normal  0.0395245 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1416  hypothetical protein  33.59 
 
 
145 aa  60.1  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.214441  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2201  hypothetical protein  37.04 
 
 
143 aa  57  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000537964  decreased coverage  0.000461392 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3335  hypothetical protein  43.55 
 
 
169 aa  55.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.382875  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3195  hypothetical protein  36.17 
 
 
143 aa  54.3  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.207149  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1439  hypothetical protein  50.68 
 
 
368 aa  53.5  0.0000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.667254 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1710  hypothetical protein  38.76 
 
 
144 aa  52.8  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.335211  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0773  hypothetical protein  35.92 
 
 
151 aa  51.6  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.487481  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>