20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1365 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1365  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  292  9e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.916958  normal  0.424206 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1322  hypothetical protein  85.6 
 
 		 149 aa  214  4e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0798716 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1416  hypothetical protein  43.51 
 
 		 145 aa  102  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.214441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7752  hypothetical protein  42.22 
 
 		 135 aa  90.9  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0552681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2201  hypothetical protein  41.55 
 
 		 143 aa  90.1  9e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000537964  decreased coverage  0.000461392 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3970  hypothetical protein  44.2 
 
 		 150 aa  84.7  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12859  hypothetical protein  37.24 
 
 		 162 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5839  hypothetical protein  38.46 
 
 		 146 aa  77  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.30575  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2060  hypothetical protein  38.03 
 
 		 156 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.725411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2123  hypothetical protein  38.03 
 
 		 156 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.126348  normal  0.0224154 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2077  hypothetical protein  38.03 
 
 		 156 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.149819  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2309  hypothetical protein  35.92 
 
 		 156 aa  74.3  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00784317  normal  0.068211 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4044  hypothetical protein  36.08 
 
 		 161 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.111666  normal  0.819815 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2148  hypothetical protein  36.3 
 
 		 145 aa  72.4  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.230881  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14530  hypothetical protein  35.77 
 
 		 323 aa  68.6  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.219653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2112  hypothetical protein  36.59 
 
 		 149 aa  65.1  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.726082 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1056  hypothetical protein  37.04 
 
 		 181 aa  62.4  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0207319  normal  0.0395245 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1710  hypothetical protein  39.29 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.335211  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3195  hypothetical protein  36.03 
 
 		 143 aa  52.8  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.207149  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3335  hypothetical protein  32.79 
 
 		 169 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.382875  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>