26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1056 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1056  hypothetical protein  100 
 
 
181 aa  346  9e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0207319  normal  0.0395245 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2112  hypothetical protein  60.58 
 
 
149 aa  162  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.726082 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7752  hypothetical protein  44.7 
 
 
135 aa  99  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0552681  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4044  hypothetical protein  37.58 
 
 
161 aa  85.9  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.111666  normal  0.819815 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3970  hypothetical protein  43.07 
 
 
150 aa  82  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0773  hypothetical protein  43.36 
 
 
151 aa  81.3  0.000000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.487481  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3335  hypothetical protein  47.58 
 
 
169 aa  80.5  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.382875  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1365  hypothetical protein  40.15 
 
 
149 aa  73.9  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.916958  normal  0.424206 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3195  hypothetical protein  40.6 
 
 
143 aa  64.7  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.207149  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2309  hypothetical protein  33.33 
 
 
156 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00784317  normal  0.068211 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12859  hypothetical protein  36 
 
 
162 aa  62  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2201  hypothetical protein  34.29 
 
 
143 aa  60.5  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000537964  decreased coverage  0.000461392 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14530  hypothetical protein  36.69 
 
 
323 aa  58.5  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.219653  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3597  hypothetical protein  37.5 
 
 
150 aa  56.6  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1322  hypothetical protein  36.11 
 
 
149 aa  55.8  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0798716 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2060  hypothetical protein  33.99 
 
 
156 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.725411  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2123  hypothetical protein  33.99 
 
 
156 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.126348  normal  0.0224154 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2077  hypothetical protein  33.99 
 
 
156 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.149819  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1439  hypothetical protein  38.12 
 
 
368 aa  54.3  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.667254 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2148  hypothetical protein  35.66 
 
 
145 aa  53.9  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.230881  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5839  hypothetical protein  34.51 
 
 
146 aa  51.6  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.30575  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1416  hypothetical protein  34.15 
 
 
145 aa  49.3  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.214441  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1847  hypothetical protein  31.93 
 
 
198 aa  47.4  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.604576 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1207  hypothetical protein  37.69 
 
 
359 aa  42.4  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0346002  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1649  hypothetical protein  31.03 
 
 
206 aa  41.6  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.108582  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2125  hypothetical protein  38.6 
 
 
192 aa  41.2  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.25809  hitchhiker  0.00273266 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>