21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1416 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1416  hypothetical protein  100 
 
 
145 aa  293  4e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.214441  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1322  hypothetical protein  43.9 
 
 
149 aa  107  5e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0798716 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1365  hypothetical protein  43.85 
 
 
149 aa  96.3  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.916958  normal  0.424206 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12859  hypothetical protein  35.38 
 
 
162 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2201  hypothetical protein  35 
 
 
143 aa  75.1  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000537964  decreased coverage  0.000461392 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2077  hypothetical protein  33.33 
 
 
156 aa  70.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.149819  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2123  hypothetical protein  33.33 
 
 
156 aa  70.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.126348  normal  0.0224154 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2060  hypothetical protein  33.33 
 
 
156 aa  70.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.725411  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5839  hypothetical protein  37.96 
 
 
146 aa  70.5  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.30575  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14530  hypothetical protein  33.33 
 
 
323 aa  67  0.00000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.219653  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7752  hypothetical protein  29.63 
 
 
135 aa  65.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0552681  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2112  hypothetical protein  34.53 
 
 
149 aa  62.8  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.726082 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3970  hypothetical protein  33.86 
 
 
150 aa  63.2  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4044  hypothetical protein  30.77 
 
 
161 aa  62  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.111666  normal  0.819815 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2309  hypothetical protein  31.88 
 
 
156 aa  62  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00784317  normal  0.068211 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2148  hypothetical protein  33.59 
 
 
145 aa  60.1  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.230881  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3335  hypothetical protein  33.06 
 
 
169 aa  51.2  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.382875  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1056  hypothetical protein  32 
 
 
181 aa  49.3  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0207319  normal  0.0395245 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0773  hypothetical protein  31.25 
 
 
151 aa  45.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.487481  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3195  hypothetical protein  27.59 
 
 
143 aa  45.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.207149  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1710  hypothetical protein  35.71 
 
 
144 aa  45.1  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.335211  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>