25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7752 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7752  hypothetical protein  100 
 
 
135 aa  269  8.000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0552681  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2112  hypothetical protein  38.93 
 
 
149 aa  88.2  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.726082 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1365  hypothetical protein  42.22 
 
 
149 aa  87.4  6e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.916958  normal  0.424206 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3195  hypothetical protein  41.84 
 
 
143 aa  87.4  7e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.207149  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1056  hypothetical protein  42.86 
 
 
181 aa  86.7  9e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0207319  normal  0.0395245 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4044  hypothetical protein  40 
 
 
161 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.111666  normal  0.819815 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1322  hypothetical protein  40.65 
 
 
149 aa  82  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0798716 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3970  hypothetical protein  38.69 
 
 
150 aa  76.6  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5839  hypothetical protein  36.23 
 
 
146 aa  76.3  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.30575  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2309  hypothetical protein  35.56 
 
 
156 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00784317  normal  0.068211 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2060  hypothetical protein  39.71 
 
 
156 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.725411  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2123  hypothetical protein  39.71 
 
 
156 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.126348  normal  0.0224154 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2077  hypothetical protein  39.71 
 
 
156 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.149819  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12859  hypothetical protein  36.03 
 
 
162 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3335  hypothetical protein  42.74 
 
 
169 aa  66.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.382875  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2148  hypothetical protein  32.28 
 
 
145 aa  63.9  0.0000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.230881  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14530  hypothetical protein  32.37 
 
 
323 aa  62.4  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.219653  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1416  hypothetical protein  29.63 
 
 
145 aa  61.2  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.214441  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0773  hypothetical protein  32.58 
 
 
151 aa  53.5  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.487481  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2201  hypothetical protein  31.88 
 
 
143 aa  51.2  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000537964  decreased coverage  0.000461392 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3567  hypothetical protein  38.89 
 
 
174 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00749457  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1439  hypothetical protein  34.09 
 
 
368 aa  46.2  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.667254 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23490  hypothetical protein  31.62 
 
 
394 aa  45.1  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0534331 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3597  hypothetical protein  32.85 
 
 
150 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1847  hypothetical protein  32.85 
 
 
198 aa  40.4  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.604576 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>