18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3195 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_3195  hypothetical protein  100 
 
 
143 aa  278  2e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.207149  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7752  hypothetical protein  41.84 
 
 
135 aa  87.4  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0552681  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2112  hypothetical protein  41.61 
 
 
149 aa  81.6  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.726082 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4044  hypothetical protein  37.6 
 
 
161 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.111666  normal  0.819815 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5839  hypothetical protein  36.5 
 
 
146 aa  58.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.30575  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2148  hypothetical protein  35.51 
 
 
145 aa  56.6  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.230881  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3970  hypothetical protein  36.17 
 
 
150 aa  54.3  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0773  hypothetical protein  34.35 
 
 
151 aa  52.4  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.487481  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2309  hypothetical protein  34.51 
 
 
156 aa  52  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00784317  normal  0.068211 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1056  hypothetical protein  36.36 
 
 
181 aa  50.8  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0207319  normal  0.0395245 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1365  hypothetical protein  36.03 
 
 
149 aa  48.9  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.916958  normal  0.424206 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2077  hypothetical protein  36.11 
 
 
156 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.149819  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2060  hypothetical protein  36.11 
 
 
156 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.725411  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2123  hypothetical protein  36.11 
 
 
156 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.126348  normal  0.0224154 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3597  hypothetical protein  32.84 
 
 
150 aa  47  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14530  hypothetical protein  34.44 
 
 
323 aa  46.2  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.219653  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12859  hypothetical protein  33.1 
 
 
162 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3335  hypothetical protein  47.27 
 
 
169 aa  40.8  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.382875  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>