19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1710 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1710  hypothetical protein  100 
 
 		 144 aa  274  2e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.335211  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2148  hypothetical protein  50.69 
 
 		 145 aa  122  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.230881  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5839  hypothetical protein  45.26 
 
 		 146 aa  108  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.30575  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4044  hypothetical protein  40.74 
 
 		 161 aa  88.2  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.111666  normal  0.819815 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2077  hypothetical protein  40.74 
 
 		 156 aa  87.8  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.149819  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14530  hypothetical protein  41.91 
 
 		 323 aa  88.2  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.219653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2060  hypothetical protein  40.74 
 
 		 156 aa  87.8  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.725411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2123  hypothetical protein  40.74 
 
 		 156 aa  87.8  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.126348  normal  0.0224154 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2309  hypothetical protein  37.78 
 
 		 156 aa  87.4  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00784317  normal  0.068211 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12859  hypothetical protein  37.78 
 
 		 162 aa  86.7  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2201  hypothetical protein  43.48 
 
 		 143 aa  78.6  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000537964  decreased coverage  0.000461392 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1365  hypothetical protein  39.29 
 
 		 149 aa  70.1  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.916958  normal  0.424206 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1322  hypothetical protein  38.1 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0798716 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3970  hypothetical protein  38.76 
 
 		 150 aa  64.7  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1416  hypothetical protein  35.71 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.214441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7752  hypothetical protein  36.5 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0552681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2112  hypothetical protein  32.86 
 
 		 149 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.726082 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3597  hypothetical protein  36.84 
 
 		 150 aa  47.4  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0773  hypothetical protein  35.37 
 
 		 151 aa  45.4  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.487481  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>