45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1882 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1882  hypothetical protein  100 
 
 		 819 aa  1679    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.135524 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3130  family 2 glycosyl transferase  37.76 
 
 		 335 aa  72.8  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.17904  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2269  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.04 
 
 		 320 aa  72.4  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000162066 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1109  glycosyl transferase family protein  34.23 
 
 		 345 aa  67.8  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.945444 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1111  glycosyl transferase family protein  30.97 
 
 		 337 aa  64.7  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.671867 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1979  glycosyl transferase family protein  42.31 
 
 		 347 aa  58.9  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3992  glycosyl transferase family protein  32.76 
 
 		 353 aa  57.4  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.562545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1967  glycosyl transferase family protein  37.76 
 
 		 300 aa  52.4  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1221  glycosyltransferase  31.73 
 
 		 310 aa  51.2  0.00007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.628351  normal  0.475099 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0593  general glycosylation pathway protein  23.01 
 
 		 309 aa  50.8  0.00009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.422601  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1145  general glycosylation pathway protein  23.01 
 
 		 309 aa  50.4  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1270  general glycosylation pathway protein  23.01 
 
 		 309 aa  50.4  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.553122  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3029  glycosyl transferase family protein  36.27 
 
 		 293 aa  49.3  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02310  glycosyl transferase  27.4 
 
 		 354 aa  49.3  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0702  glycosyl transferase family 2  28.32 
 
 		 315 aa  49.3  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3908  glycosyl transferase, WecB/TagA/CpsF family  36.28 
 
 		 907 aa  48.5  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1966  putative glycosyl transferase  37.04 
 
 		 389 aa  48.9  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.752559  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0668  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.04 
 
 		 347 aa  48.5  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.576238  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0574  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.04 
 
 		 347 aa  48.5  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0854  glycosyl transferase family 2  24.89 
 
 		 354 aa  48.5  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3111  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 		 297 aa  48.1  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3171  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 		 297 aa  48.1  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.675731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1257  glycosyl transferase family protein  34.02 
 
 		 322 aa  47.4  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0339  glycosyl transferase family 2  36.19 
 
 		 304 aa  47.4  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.479436  normal  0.396217 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4785  glycosyl transferase family 2  30.28 
 
 		 259 aa  47.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0671462 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1697  glycosyl transferase family protein  27.43 
 
 		 336 aa  47.4  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.591253  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0124  glycosyl transferase family 2  27.36 
 
 		 345 aa  46.6  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000042136  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1152  glycosyl transferase family 2  32.43 
 
 		 370 aa  46.2  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.186653  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2717  glycosyl transferase family protein  30 
 
 		 377 aa  46.6  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2382  glycosyl transferase family protein  33.64 
 
 		 319 aa  47  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  25.69 
 
 		 703 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0390  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 341 aa  46.6  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1437  capsular polysaccharide biosynthesis protein  26.4 
 
 		 324 aa  46.2  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0798  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 		 316 aa  45.8  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0913386  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2383  glycosyl transferase family protein  31.68 
 
 		 316 aa  45.8  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30100  Glycosyl transferase, family 2 protein  25 
 
 		 336 aa  45.8  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1552  glycosyl transferase family 2  41.18 
 
 		 299 aa  45.8  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2811  glycosyl transferase family 2  29.13 
 
 		 307 aa  45.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.104457 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0362  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 		 364 aa  45.4  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.279909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2934  family 2 glycosyl transferase  34.09 
 
 		 295 aa  45.4  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.349608 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4940  glycosyl transferase family protein  29.21 
 
 		 336 aa  45.4  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1307  glycosyl transferase family protein  28.81 
 
 		 335 aa  45.1  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1122  glycosyl transferase family protein  25.74 
 
 		 364 aa  44.7  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2528  glycosyl transferase family 2  26.89 
 
 		 307 aa  44.3  0.009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.591132  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2749  glycosyl transferase family protein  32.21 
 
 		 288 aa  44.3  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.989709  normal  0.0515771 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>