22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1476 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1476  hypothetical protein  100 
 
 		 197 aa  398  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1010  hypothetical protein  60 
 
 		 184 aa  215  4e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4583  hypothetical protein  48.9 
 
 		 184 aa  184  9e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1789  hypothetical protein  47.28 
 
 		 184 aa  178  5.999999999999999e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.721327  normal  0.0153035 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2358  hypothetical protein  39.56 
 
 		 181 aa  145  4.0000000000000006e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4268  hypothetical protein  36.76 
 
 		 182 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1844  hypothetical protein  35.14 
 
 		 182 aa  123  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.944484  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0983  hypothetical protein  39.52 
 
 		 184 aa  123  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3327  hypothetical protein  38.32 
 
 		 184 aa  121  5e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3046  hypothetical protein  33.15 
 
 		 190 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2935  hypothetical protein  37.72 
 
 		 201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2928  hypothetical protein  34.91 
 
 		 190 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277474 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3126  hypothetical protein  38.37 
 
 		 183 aa  108  4.0000000000000004e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1433  hypothetical protein  31.74 
 
 		 186 aa  108  7.000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2260  hypothetical protein  32.03 
 
 		 190 aa  106  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.209186  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3039  hypothetical protein  32.43 
 
 		 193 aa  106  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.57913  normal  0.53806 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5580  hypothetical protein  31.58 
 
 		 187 aa  105  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.338865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0251  hypothetical protein  32.42 
 
 		 180 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02140  hypothetical protein  31.87 
 
 		 180 aa  102  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.541168 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1552  hypothetical protein  27.37 
 
 		 176 aa  88.6  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.67291  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2113  hypothetical protein  30 
 
 		 176 aa  87.8  8e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1586  hypothetical protein  25.13 
 
 		 210 aa  77.4  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.693113 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>