22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1010 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_1010  hypothetical protein  100 
 
 
184 aa  373  1e-102  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1476  hypothetical protein  60 
 
 
197 aa  215  2.9999999999999998e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4583  hypothetical protein  52.72 
 
 
184 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1789  hypothetical protein  45.65 
 
 
184 aa  174  8e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.721327  normal  0.0153035 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2358  hypothetical protein  42.61 
 
 
181 aa  149  2e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3046  hypothetical protein  32.61 
 
 
190 aa  125  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3126  hypothetical protein  40.48 
 
 
183 aa  125  3e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2935  hypothetical protein  41.07 
 
 
201 aa  122  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4268  hypothetical protein  34.24 
 
 
182 aa  120  8e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3327  hypothetical protein  38.1 
 
 
184 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1844  hypothetical protein  34.24 
 
 
182 aa  115  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.944484  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1433  hypothetical protein  35.71 
 
 
186 aa  114  6.9999999999999995e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0983  hypothetical protein  38.1 
 
 
184 aa  114  8.999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5580  hypothetical protein  35.67 
 
 
187 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.338865  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2928  hypothetical protein  35.5 
 
 
190 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.277474 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3039  hypothetical protein  37.43 
 
 
193 aa  107  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.57913  normal  0.53806 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2260  hypothetical protein  34.5 
 
 
190 aa  106  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.209186  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0251  hypothetical protein  31.87 
 
 
180 aa  99  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02140  hypothetical protein  30.77 
 
 
180 aa  94.4  9e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.541168 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1552  hypothetical protein  28.89 
 
 
176 aa  94.4  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.67291  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1586  hypothetical protein  26.07 
 
 
210 aa  86.7  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.693113 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2113  hypothetical protein  30.05 
 
 
176 aa  84  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>