22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1552 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1552  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  362  2e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.67291  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2113  hypothetical protein  55.11 
 
 		 176 aa  191  4e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4268  hypothetical protein  37.29 
 
 		 182 aa  134  6.0000000000000005e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1844  hypothetical protein  38.07 
 
 		 182 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.944484  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0251  hypothetical protein  44.69 
 
 		 180 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02140  hypothetical protein  44.69 
 
 		 180 aa  129  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.541168 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3046  hypothetical protein  32.24 
 
 		 190 aa  108  5e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2358  hypothetical protein  32.37 
 
 		 181 aa  104  5e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1789  hypothetical protein  30.56 
 
 		 184 aa  94.4  7e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.721327  normal  0.0153035 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1010  hypothetical protein  28.89 
 
 		 184 aa  94.4  9e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4583  hypothetical protein  29.28 
 
 		 184 aa  92.4  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2260  hypothetical protein  30.95 
 
 		 190 aa  92.4  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.209186  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1476  hypothetical protein  27.37 
 
 		 197 aa  88.6  4e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5580  hypothetical protein  27.56 
 
 		 187 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.338865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1433  hypothetical protein  27.22 
 
 		 186 aa  73.9  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3039  hypothetical protein  28.66 
 
 		 193 aa  71.2  0.000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.57913  normal  0.53806 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2928  hypothetical protein  28.85 
 
 		 190 aa  70.9  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277474 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0983  hypothetical protein  28.48 
 
 		 184 aa  69.3  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3327  hypothetical protein  27.81 
 
 		 184 aa  68.9  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1586  hypothetical protein  24.73 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.693113 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3126  hypothetical protein  26.29 
 
 		 183 aa  60.5  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2935  hypothetical protein  25.71 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>