22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0983 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0983  hypothetical protein  100 
 
 		 184 aa  382  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3327  hypothetical protein  96.2 
 
 		 184 aa  367  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3126  hypothetical protein  73.22 
 
 		 183 aa  282  2.0000000000000002e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2935  hypothetical protein  69.83 
 
 		 201 aa  259  2e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3039  hypothetical protein  55.49 
 
 		 193 aa  194  9e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.57913  normal  0.53806 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2928  hypothetical protein  52.69 
 
 		 190 aa  191  5e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277474 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5580  hypothetical protein  47.75 
 
 		 187 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.338865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2260  hypothetical protein  48 
 
 		 190 aa  171  5.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.209186  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1433  hypothetical protein  42.53 
 
 		 186 aa  154  7e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1789  hypothetical protein  35.56 
 
 		 184 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.721327  normal  0.0153035 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1476  hypothetical protein  39.52 
 
 		 197 aa  123  1e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4583  hypothetical protein  32.78 
 
 		 184 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1010  hypothetical protein  38.1 
 
 		 184 aa  114  8.999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1586  hypothetical protein  31.6 
 
 		 210 aa  106  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.693113 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2358  hypothetical protein  30.77 
 
 		 181 aa  103  1e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3046  hypothetical protein  29.12 
 
 		 190 aa  89.7  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4268  hypothetical protein  26.83 
 
 		 182 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1552  hypothetical protein  28.48 
 
 		 176 aa  69.3  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.67291  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1844  hypothetical protein  30.29 
 
 		 182 aa  67.8  0.00000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.944484  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0251  hypothetical protein  28.74 
 
 		 180 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02140  hypothetical protein  28.14 
 
 		 180 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.541168 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2113  hypothetical protein  25.16 
 
 		 176 aa  53.1  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>