22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1789 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_1789  hypothetical protein  100 
 
 
184 aa  369  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.721327  normal  0.0153035 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4583  hypothetical protein  73.37 
 
 
184 aa  271  6e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1476  hypothetical protein  47.28 
 
 
197 aa  178  4.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1010  hypothetical protein  45.65 
 
 
184 aa  174  8e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0983  hypothetical protein  35.56 
 
 
184 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3327  hypothetical protein  36.11 
 
 
184 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2358  hypothetical protein  33.7 
 
 
181 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1433  hypothetical protein  35.71 
 
 
186 aa  118  3.9999999999999996e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3046  hypothetical protein  34.27 
 
 
190 aa  118  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5580  hypothetical protein  35.2 
 
 
187 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.338865  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1844  hypothetical protein  34.59 
 
 
182 aa  115  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.944484  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2935  hypothetical protein  33.89 
 
 
201 aa  114  7.999999999999999e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2260  hypothetical protein  32.43 
 
 
190 aa  112  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.209186  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3126  hypothetical protein  32.43 
 
 
183 aa  111  5e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4268  hypothetical protein  32.74 
 
 
182 aa  107  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2928  hypothetical protein  27.81 
 
 
190 aa  103  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.277474 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3039  hypothetical protein  30.17 
 
 
193 aa  97.8  9e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.57913  normal  0.53806 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1552  hypothetical protein  30.56 
 
 
176 aa  94.4  8e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.67291  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1586  hypothetical protein  30.95 
 
 
210 aa  92.8  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.693113 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0251  hypothetical protein  32.97 
 
 
180 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02140  hypothetical protein  32.42 
 
 
180 aa  92.4  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.541168 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2113  hypothetical protein  28.73 
 
 
176 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>