22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3046 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_3046  hypothetical protein  100 
 
 
190 aa  392  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2358  hypothetical protein  40.91 
 
 
181 aa  153  1e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1010  hypothetical protein  32.61 
 
 
184 aa  125  3e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4583  hypothetical protein  36.56 
 
 
184 aa  124  6e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1476  hypothetical protein  33.15 
 
 
197 aa  120  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1789  hypothetical protein  34.27 
 
 
184 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.721327  normal  0.0153035 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1552  hypothetical protein  32.24 
 
 
176 aa  108  6e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.67291  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4268  hypothetical protein  28.65 
 
 
182 aa  104  6e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1844  hypothetical protein  31.32 
 
 
182 aa  103  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.944484  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0251  hypothetical protein  35.23 
 
 
180 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2260  hypothetical protein  31.55 
 
 
190 aa  97.4  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.209186  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1433  hypothetical protein  28.07 
 
 
186 aa  96.3  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02140  hypothetical protein  33.52 
 
 
180 aa  95.9  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.541168 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5580  hypothetical protein  30 
 
 
187 aa  93.6  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.338865  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2928  hypothetical protein  32.93 
 
 
190 aa  93.6  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.277474 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2113  hypothetical protein  32.6 
 
 
176 aa  92.4  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1586  hypothetical protein  25.38 
 
 
210 aa  92.4  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.693113 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3327  hypothetical protein  29.67 
 
 
184 aa  90.1  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3039  hypothetical protein  30 
 
 
193 aa  89  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.57913  normal  0.53806 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0983  hypothetical protein  29.12 
 
 
184 aa  89.7  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2935  hypothetical protein  30.49 
 
 
201 aa  86.3  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3126  hypothetical protein  26.59 
 
 
183 aa  76.6  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>