22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2260 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2260  hypothetical protein  100 
 
 		 190 aa  395  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.209186  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2928  hypothetical protein  61.08 
 
 		 190 aa  242  3e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277474 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3039  hypothetical protein  58.25 
 
 		 193 aa  228  3e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.57913  normal  0.53806 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5580  hypothetical protein  58.76 
 
 		 187 aa  222  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.338865  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3126  hypothetical protein  51.91 
 
 		 183 aa  181  5.0000000000000004e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1433  hypothetical protein  51.46 
 
 		 186 aa  177  7e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3327  hypothetical protein  49.18 
 
 		 184 aa  173  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0983  hypothetical protein  48 
 
 		 184 aa  171  6.999999999999999e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2935  hypothetical protein  46.55 
 
 		 201 aa  170  9e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1789  hypothetical protein  32.43 
 
 		 184 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.721327  normal  0.0153035 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1586  hypothetical protein  35.48 
 
 		 210 aa  111  8.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.693113 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4583  hypothetical protein  32.07 
 
 		 184 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2358  hypothetical protein  31.32 
 
 		 181 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1476  hypothetical protein  32.03 
 
 		 197 aa  106  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1010  hypothetical protein  34.5 
 
 		 184 aa  106  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3046  hypothetical protein  31.55 
 
 		 190 aa  97.4  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1552  hypothetical protein  30.95 
 
 		 176 aa  92.4  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.67291  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4268  hypothetical protein  28.75 
 
 		 182 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1844  hypothetical protein  31.61 
 
 		 182 aa  74.3  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.944484  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2113  hypothetical protein  31.21 
 
 		 176 aa  61.2  0.000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0251  hypothetical protein  28.39 
 
 		 180 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02140  hypothetical protein  27.74 
 
 		 180 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.541168 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>