22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_02140 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_02140  hypothetical protein  100 
 
 		 180 aa  367  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.541168 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0251  hypothetical protein  98.33 
 
 		 180 aa  360  8e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1552  hypothetical protein  44.69 
 
 		 176 aa  129  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.67291  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1844  hypothetical protein  38.89 
 
 		 182 aa  129  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.944484  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2113  hypothetical protein  45.51 
 
 		 176 aa  129  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4268  hypothetical protein  34.66 
 
 		 182 aa  114  8.999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2358  hypothetical protein  31.79 
 
 		 181 aa  107  1e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1476  hypothetical protein  31.87 
 
 		 197 aa  102  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3046  hypothetical protein  33.52 
 
 		 190 aa  95.9  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1010  hypothetical protein  30.77 
 
 		 184 aa  94.4  8e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1789  hypothetical protein  32.42 
 
 		 184 aa  92.4  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.721327  normal  0.0153035 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4583  hypothetical protein  29.19 
 
 		 184 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1433  hypothetical protein  27.81 
 
 		 186 aa  75.1  0.0000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3126  hypothetical protein  30 
 
 		 183 aa  72  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5580  hypothetical protein  27.01 
 
 		 187 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.338865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3039  hypothetical protein  26.59 
 
 		 193 aa  68.2  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.57913  normal  0.53806 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2935  hypothetical protein  29.24 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0983  hypothetical protein  28.14 
 
 		 184 aa  62.8  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3327  hypothetical protein  28.99 
 
 		 184 aa  62  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1586  hypothetical protein  25.59 
 
 		 210 aa  62  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.693113 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2928  hypothetical protein  26.16 
 
 		 190 aa  62  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277474 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2260  hypothetical protein  27.74 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.209186  normal  0.404919 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>