22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3039 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3039  hypothetical protein  100 
 
 		 193 aa  398  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.57913  normal  0.53806 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2928  hypothetical protein  72.63 
 
 		 190 aa  292  2e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277474 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2260  hypothetical protein  58.25 
 
 		 190 aa  228  3e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.209186  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5580  hypothetical protein  54.01 
 
 		 187 aa  207  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.338865  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3126  hypothetical protein  56.59 
 
 		 183 aa  197  9e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0983  hypothetical protein  55.49 
 
 		 184 aa  194  9e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3327  hypothetical protein  54.4 
 
 		 184 aa  191  8e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2935  hypothetical protein  52.49 
 
 		 201 aa  186  2e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1433  hypothetical protein  51.76 
 
 		 186 aa  179  2.9999999999999997e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1010  hypothetical protein  37.43 
 
 		 184 aa  107  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1476  hypothetical protein  32.43 
 
 		 197 aa  106  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2358  hypothetical protein  31.46 
 
 		 181 aa  101  7e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1586  hypothetical protein  33.17 
 
 		 210 aa  100  9e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.693113 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1789  hypothetical protein  30.17 
 
 		 184 aa  97.8  9e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.721327  normal  0.0153035 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4583  hypothetical protein  31.15 
 
 		 184 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3046  hypothetical protein  30 
 
 		 190 aa  89  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4268  hypothetical protein  26.8 
 
 		 182 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1844  hypothetical protein  28.72 
 
 		 182 aa  71.2  0.000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.944484  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1552  hypothetical protein  28.66 
 
 		 176 aa  71.2  0.000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.67291  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0251  hypothetical protein  27.17 
 
 		 180 aa  68.6  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02140  hypothetical protein  26.59 
 
 		 180 aa  68.2  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.541168 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2113  hypothetical protein  24.38 
 
 		 176 aa  45.4  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>