22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3327 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_3327  hypothetical protein  100 
 
 
184 aa  381  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0983  hypothetical protein  96.2 
 
 
184 aa  367  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3126  hypothetical protein  72.68 
 
 
183 aa  277  8e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2935  hypothetical protein  69.27 
 
 
201 aa  254  5e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3039  hypothetical protein  54.4 
 
 
193 aa  191  7e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.57913  normal  0.53806 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2928  hypothetical protein  52.2 
 
 
190 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.277474 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5580  hypothetical protein  48.88 
 
 
187 aa  175  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.338865  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2260  hypothetical protein  49.18 
 
 
190 aa  173  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.209186  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1433  hypothetical protein  42.53 
 
 
186 aa  154  8e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1789  hypothetical protein  36.11 
 
 
184 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.721327  normal  0.0153035 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1476  hypothetical protein  38.32 
 
 
197 aa  121  5e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4583  hypothetical protein  33.33 
 
 
184 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1010  hypothetical protein  38.1 
 
 
184 aa  116  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1586  hypothetical protein  30.19 
 
 
210 aa  103  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.693113 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2358  hypothetical protein  30.13 
 
 
181 aa  102  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3046  hypothetical protein  29.67 
 
 
190 aa  90.1  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4268  hypothetical protein  26.83 
 
 
182 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1552  hypothetical protein  27.81 
 
 
176 aa  68.9  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.67291  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1844  hypothetical protein  29.24 
 
 
182 aa  67.8  0.00000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.944484  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0251  hypothetical protein  29.59 
 
 
180 aa  65.1  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02140  hypothetical protein  28.99 
 
 
180 aa  62  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.541168 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2113  hypothetical protein  25.81 
 
 
176 aa  53.9  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>