18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1271 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1271  hypothetical protein  100 
 
 
245 aa  513  1.0000000000000001e-145  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.926997  normal  0.593282 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4210  glycosyl transferase family 8  46.19 
 
 
241 aa  231  9e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2287  hypothetical protein  31.68 
 
 
324 aa  117  9.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4206  glycosyl transferase family 8  27.64 
 
 
306 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4197  glycosyl transferase family 8  30.47 
 
 
302 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.772667 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2294  hypothetical protein  26.69 
 
 
278 aa  101  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.650616  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3078  hypothetical protein  36.24 
 
 
294 aa  83.2  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.772743  normal  0.632907 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44420  hypothetical protein  28.45 
 
 
779 aa  65.9  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1513  hypothetical protein  25.74 
 
 
232 aa  65.9  0.0000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0297183  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2115  hypothetical protein  26.76 
 
 
455 aa  61.6  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.641329  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0416  hypothetical protein  27.83 
 
 
233 aa  61.6  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25541  hypothetical protein  31.88 
 
 
237 aa  60.8  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1814  hypothetical protein  27.23 
 
 
229 aa  60.8  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5018  hypothetical protein  26.87 
 
 
229 aa  60.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.595113 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0179  hypothetical protein  27.27 
 
 
236 aa  57.4  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.229321  normal  0.0559452 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0140  hypothetical protein  27.27 
 
 
236 aa  57.4  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  hitchhiker  0.0050523  normal  0.0139125 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0208  hypothetical protein  30.77 
 
 
236 aa  55.1  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0972  hypothetical protein  21.86 
 
 
223 aa  47  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>