15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1814 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1814  hypothetical protein  100 
 
 		 229 aa  483  1e-136  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5018  hypothetical protein  79.19 
 
 		 229 aa  382  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.595113 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1513  hypothetical protein  58.93 
 
 		 232 aa  286  2e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0297183  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0140  hypothetical protein  51.33 
 
 		 236 aa  245  3e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  hitchhiker  0.0050523  normal  0.0139125 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0179  hypothetical protein  51.33 
 
 		 236 aa  245  3e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.229321  normal  0.0559452 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0208  hypothetical protein  51.32 
 
 		 236 aa  244  8e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25541  hypothetical protein  50.65 
 
 		 237 aa  238  6.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0972  hypothetical protein  48.62 
 
 		 223 aa  215  4e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0416  hypothetical protein  47.3 
 
 		 233 aa  207  1e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2115  hypothetical protein  43.86 
 
 		 455 aa  206  2e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.641329  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4206  glycosyl transferase family 8  28.85 
 
 		 306 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4197  glycosyl transferase family 8  34.65 
 
 		 302 aa  65.9  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.772667 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1271  hypothetical protein  27.23 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.926997  normal  0.593282 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4210  glycosyl transferase family 8  25.12 
 
 		 241 aa  52  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2294  hypothetical protein  22.36 
 
 		 278 aa  47.4  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.650616  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>