16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0972 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0972  hypothetical protein  100 
 
 		 223 aa  473  1e-132  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1814  hypothetical protein  48.62 
 
 		 229 aa  215  4e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5018  hypothetical protein  48.61 
 
 		 229 aa  214  9.999999999999999e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.595113 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0416  hypothetical protein  43.11 
 
 		 233 aa  187  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1513  hypothetical protein  44.24 
 
 		 232 aa  181  7e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0297183  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2115  hypothetical protein  41.47 
 
 		 455 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.641329  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0140  hypothetical protein  41.7 
 
 		 236 aa  172  5e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  hitchhiker  0.0050523  normal  0.0139125 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0179  hypothetical protein  41.7 
 
 		 236 aa  172  5e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.229321  normal  0.0559452 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0208  hypothetical protein  40.81 
 
 		 236 aa  167  2e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25541  hypothetical protein  41.41 
 
 		 237 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4206  glycosyl transferase family 8  30.3 
 
 		 306 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4210  glycosyl transferase family 8  27.27 
 
 		 241 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2287  hypothetical protein  25.32 
 
 		 324 aa  51.2  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4197  glycosyl transferase family 8  30.53 
 
 		 302 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.772667 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2294  hypothetical protein  24.3 
 
 		 278 aa  47.8  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.650616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1271  hypothetical protein  21.86 
 
 		 245 aa  47  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.926997  normal  0.593282 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>