24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2115 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2115  hypothetical protein  100 
 
 
455 aa  946    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.641329  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0416  hypothetical protein  74.25 
 
 
233 aa  385  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0417  hypothetical protein  48.28 
 
 
204 aa  210  4e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1814  hypothetical protein  43.86 
 
 
229 aa  206  6e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5018  hypothetical protein  44.8 
 
 
229 aa  203  6e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.595113 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1513  hypothetical protein  44.14 
 
 
232 aa  191  2e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0297183  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0322  hypothetical protein  42.64 
 
 
224 aa  183  4.0000000000000006e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0338  hypothetical protein  42.13 
 
 
224 aa  181  2e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.752194  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0972  hypothetical protein  41.47 
 
 
223 aa  179  8e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0179  hypothetical protein  42.51 
 
 
236 aa  178  1e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.229321  normal  0.0559452 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0140  hypothetical protein  42.51 
 
 
236 aa  178  1e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  hitchhiker  0.0050523  normal  0.0139125 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25541  hypothetical protein  41.86 
 
 
237 aa  174  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0208  hypothetical protein  40.48 
 
 
236 aa  174  3.9999999999999995e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0196  hypothetical protein  29.06 
 
 
211 aa  79.7  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.641863 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0139  hypothetical protein  27.5 
 
 
211 aa  76.6  0.0000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.334935 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3478  urease accessory protein  30.62 
 
 
214 aa  73.6  0.000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3308  urease-associated protein  29.95 
 
 
207 aa  71.2  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3052  putative urease-associated protein  28.5 
 
 
212 aa  67.4  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166589  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2384  putative urease accessory protein  28.57 
 
 
216 aa  62.8  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.345429 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1271  hypothetical protein  26.76 
 
 
245 aa  61.6  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.926997  normal  0.593282 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4206  glycosyl transferase family 8  25.65 
 
 
306 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0280  hypothetical protein  27.22 
 
 
215 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4197  glycosyl transferase family 8  25 
 
 
302 aa  57.4  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.772667 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4210  glycosyl transferase family 8  21.43 
 
 
241 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.499791 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>