16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0208 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0208  hypothetical protein  100 
 
 
236 aa  496  1e-139  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0140  hypothetical protein  88.98 
 
 
236 aa  447  1e-125  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  hitchhiker  0.0050523  normal  0.0139125 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0179  hypothetical protein  88.98 
 
 
236 aa  447  1e-125  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.229321  normal  0.0559452 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25541  hypothetical protein  80 
 
 
237 aa  392  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1814  hypothetical protein  51.32 
 
 
229 aa  244  8e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5018  hypothetical protein  50 
 
 
229 aa  238  4e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.595113 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1513  hypothetical protein  53.85 
 
 
232 aa  232  3e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0297183  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0416  hypothetical protein  41.13 
 
 
233 aa  176  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2115  hypothetical protein  40.48 
 
 
455 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.641329  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0972  hypothetical protein  40.81 
 
 
223 aa  167  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4206  glycosyl transferase family 8  31.65 
 
 
306 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2294  hypothetical protein  29.03 
 
 
278 aa  70.1  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.650616  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4197  glycosyl transferase family 8  37.37 
 
 
302 aa  62.8  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.772667 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4210  glycosyl transferase family 8  24.48 
 
 
241 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1271  hypothetical protein  30.77 
 
 
245 aa  55.1  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.926997  normal  0.593282 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2287  hypothetical protein  24 
 
 
324 aa  46.2  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>