18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4206 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4206  glycosyl transferase family 8  100 
 
 
306 aa  641    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4197  glycosyl transferase family 8  39.37 
 
 
302 aa  199  6e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.772667 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2294  hypothetical protein  31.05 
 
 
278 aa  113  5e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.650616  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2287  hypothetical protein  31.51 
 
 
324 aa  110  3e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1271  hypothetical protein  27.64 
 
 
245 aa  108  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.926997  normal  0.593282 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4210  glycosyl transferase family 8  27.5 
 
 
241 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1513  hypothetical protein  29.18 
 
 
232 aa  88.6  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0297183  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0972  hypothetical protein  30.3 
 
 
223 aa  77.8  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0140  hypothetical protein  31.65 
 
 
236 aa  76.3  0.0000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  hitchhiker  0.0050523  normal  0.0139125 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0179  hypothetical protein  31.65 
 
 
236 aa  76.3  0.0000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.229321  normal  0.0559452 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25541  hypothetical protein  39.36 
 
 
237 aa  76.3  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0208  hypothetical protein  31.65 
 
 
236 aa  74.3  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1814  hypothetical protein  28.85 
 
 
229 aa  73.9  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0416  hypothetical protein  27.95 
 
 
233 aa  69.7  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5018  hypothetical protein  27.5 
 
 
229 aa  68.9  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.595113 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3078  hypothetical protein  24.77 
 
 
294 aa  68.6  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.772743  normal  0.632907 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44420  hypothetical protein  29.81 
 
 
779 aa  66.6  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2115  hypothetical protein  25.65 
 
 
455 aa  59.3  0.00000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.641329  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>