16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2287 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2287  hypothetical protein  100 
 
 		 324 aa  662    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2294  hypothetical protein  35.74 
 
 		 278 aa  164  2.0000000000000002e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.650616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4210  glycosyl transferase family 8  31.84 
 
 		 241 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1271  hypothetical protein  32.44 
 
 		 245 aa  125  1e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.926997  normal  0.593282 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4206  glycosyl transferase family 8  31.95 
 
 		 306 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4197  glycosyl transferase family 8  31.92 
 
 		 302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.772667 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3078  hypothetical protein  37.66 
 
 		 294 aa  88.6  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.772743  normal  0.632907 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44420  hypothetical protein  27.82 
 
 		 779 aa  77.4  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1513  hypothetical protein  25.79 
 
 		 232 aa  67.4  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0297183  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0140  hypothetical protein  25.33 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  hitchhiker  0.0050523  normal  0.0139125 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0179  hypothetical protein  25.33 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.229321  normal  0.0559452 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0972  hypothetical protein  25.97 
 
 		 223 aa  54.7  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25541  hypothetical protein  26.82 
 
 		 237 aa  54.3  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5018  hypothetical protein  26.25 
 
 		 229 aa  50.4  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.595113 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0416  hypothetical protein  26.75 
 
 		 233 aa  50.4  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0208  hypothetical protein  24.67 
 
 		 236 aa  49.7  0.00007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>