16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1513 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1513  hypothetical protein  100 
 
 		 232 aa  484  1e-136  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0297183  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1814  hypothetical protein  58.93 
 
 		 229 aa  286  2e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5018  hypothetical protein  59.64 
 
 		 229 aa  285  2.9999999999999996e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.595113 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0140  hypothetical protein  54.42 
 
 		 236 aa  236  2e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  hitchhiker  0.0050523  normal  0.0139125 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0179  hypothetical protein  54.42 
 
 		 236 aa  236  2e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.229321  normal  0.0559452 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0208  hypothetical protein  53.85 
 
 		 236 aa  232  3e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25541  hypothetical protein  52.8 
 
 		 237 aa  219  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2115  hypothetical protein  44.14 
 
 		 455 aa  191  6e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.641329  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0416  hypothetical protein  42.53 
 
 		 233 aa  181  6e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0972  hypothetical protein  44.24 
 
 		 223 aa  181  8.000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4206  glycosyl transferase family 8  29.18 
 
 		 306 aa  88.6  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4197  glycosyl transferase family 8  30.56 
 
 		 302 aa  68.9  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.772667 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1271  hypothetical protein  25.74 
 
 		 245 aa  65.9  0.0000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.926997  normal  0.593282 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2287  hypothetical protein  25.68 
 
 		 324 aa  63.5  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2294  hypothetical protein  27.91 
 
 		 278 aa  61.6  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.650616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4210  glycosyl transferase family 8  24.27 
 
 		 241 aa  55.1  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.499791 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>