16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0140 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0140  hypothetical protein  100 
 
 
236 aa  495  1e-139  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  hitchhiker  0.0050523  normal  0.0139125 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0179  hypothetical protein  100 
 
 
236 aa  495  1e-139  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.229321  normal  0.0559452 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0208  hypothetical protein  88.98 
 
 
236 aa  447  1e-125  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25541  hypothetical protein  81.86 
 
 
237 aa  403  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1814  hypothetical protein  51.33 
 
 
229 aa  245  4e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5018  hypothetical protein  49.35 
 
 
229 aa  237  1e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.595113 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1513  hypothetical protein  54.42 
 
 
232 aa  236  2e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0297183  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0416  hypothetical protein  43.26 
 
 
233 aa  181  8.000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2115  hypothetical protein  42.51 
 
 
455 aa  178  4.999999999999999e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.641329  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0972  hypothetical protein  41.7 
 
 
223 aa  172  5e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4206  glycosyl transferase family 8  31.65 
 
 
306 aa  76.3  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2294  hypothetical protein  27.89 
 
 
278 aa  68.6  0.00000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.650616  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4210  glycosyl transferase family 8  29.17 
 
 
241 aa  63.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1271  hypothetical protein  27.27 
 
 
245 aa  57.4  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.926997  normal  0.593282 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4197  glycosyl transferase family 8  34.74 
 
 
302 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.772667 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2287  hypothetical protein  25.33 
 
 
324 aa  54.3  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>