17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5018 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_5018  hypothetical protein  100 
 
 		 229 aa  481  1e-135  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.595113 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1814  hypothetical protein  79.19 
 
 		 229 aa  382  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1513  hypothetical protein  59.64 
 
 		 232 aa  285  2.9999999999999996e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0297183  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0208  hypothetical protein  50 
 
 		 236 aa  238  4e-62  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0179  hypothetical protein  49.35 
 
 		 236 aa  237  1e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.229321  normal  0.0559452 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0140  hypothetical protein  49.35 
 
 		 236 aa  237  1e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  hitchhiker  0.0050523  normal  0.0139125 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25541  hypothetical protein  47.03 
 
 		 237 aa  218  3.9999999999999997e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0972  hypothetical protein  48.61 
 
 		 223 aa  214  9.999999999999999e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2115  hypothetical protein  44.8 
 
 		 455 aa  203  2e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.641329  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0416  hypothetical protein  45.37 
 
 		 233 aa  198  5e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4206  glycosyl transferase family 8  27.5 
 
 		 306 aa  68.9  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1271  hypothetical protein  26.87 
 
 		 245 aa  60.5  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.926997  normal  0.593282 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4197  glycosyl transferase family 8  33.7 
 
 		 302 aa  59.3  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.772667 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4210  glycosyl transferase family 8  28.48 
 
 		 241 aa  48.9  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2287  hypothetical protein  25.64 
 
 		 324 aa  45.8  0.0006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2294  hypothetical protein  24.18 
 
 		 278 aa  44.7  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.650616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0059  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  26.97 
 
 		 317 aa  43.5  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00101  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>