27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3759 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_3759  hypothetical protein  100 
 
 
260 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.553951  hitchhiker  0.00446449 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3593  hypothetical protein  79.54 
 
 
266 aa  437  1e-121  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3217  hypothetical protein  74.9 
 
 
259 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.984934  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3002  hypothetical protein  71.04 
 
 
270 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2119  hypothetical protein  64.34 
 
 
262 aa  351  8.999999999999999e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.516183  normal  0.876146 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1840  hypothetical protein  65.5 
 
 
262 aa  350  1e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.109043  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2344  hypothetical protein  64.34 
 
 
262 aa  350  2e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.492885  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2228  hypothetical protein  64.09 
 
 
262 aa  350  2e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.303656  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2199  hypothetical protein  65.23 
 
 
260 aa  348  4e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.45244  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2518  hypothetical protein  65.23 
 
 
260 aa  348  5e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1896  hypothetical protein  64.84 
 
 
260 aa  347  8e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.154307  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2079  hypothetical protein  64.06 
 
 
292 aa  342  2e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2131  hypothetical protein  64.34 
 
 
262 aa  332  5e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2094  hypothetical protein  54.3 
 
 
300 aa  304  9.000000000000001e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06041  hypothetical protein  59.22 
 
 
293 aa  297  1e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1596  hypothetical protein  49.65 
 
 
298 aa  267  1e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000245931  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03643  hypothetical protein  45.14 
 
 
262 aa  212  4.9999999999999996e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000329012  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3852  hypothetical protein  44.31 
 
 
260 aa  204  1e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4068  hypothetical protein  43.36 
 
 
266 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2295  hypothetical protein  38.11 
 
 
249 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.813808 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4184  hypothetical protein  31.09 
 
 
1909 aa  98.2  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4772  hypothetical protein  29.23 
 
 
500 aa  90.1  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0124  hypothetical protein  31.06 
 
 
591 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108457 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0037  hypothetical protein  31.06 
 
 
576 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0155  hypothetical protein  30.53 
 
 
591 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000390792 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1276  hypothetical protein  33.6 
 
 
784 aa  63.2  0.000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0797799  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1222  hypothetical protein  34.82 
 
 
784 aa  62.8  0.000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0212041  normal  0.276466 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>