27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03643 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_03643  hypothetical protein  100 
 
 
262 aa  547  1e-155  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000329012  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4068  hypothetical protein  59.23 
 
 
266 aa  326  2.0000000000000001e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3852  hypothetical protein  50.59 
 
 
260 aa  276  3e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2518  hypothetical protein  48.25 
 
 
260 aa  239  2e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1896  hypothetical protein  48.25 
 
 
260 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.154307  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1840  hypothetical protein  48.64 
 
 
262 aa  236  2e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.109043  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2199  hypothetical protein  47.86 
 
 
260 aa  234  9e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.45244  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2079  hypothetical protein  46.39 
 
 
292 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2295  hypothetical protein  48.13 
 
 
249 aa  233  2.0000000000000002e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.813808 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2228  hypothetical protein  46.69 
 
 
262 aa  233  3e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.303656  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2344  hypothetical protein  46.88 
 
 
262 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.492885  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2119  hypothetical protein  46.88 
 
 
262 aa  230  2e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.516183  normal  0.876146 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2131  hypothetical protein  46.88 
 
 
262 aa  223  2e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06041  hypothetical protein  47.66 
 
 
293 aa  216  2.9999999999999998e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3002  hypothetical protein  46.06 
 
 
270 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3759  hypothetical protein  45.14 
 
 
260 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.553951  hitchhiker  0.00446449 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3593  hypothetical protein  44.92 
 
 
266 aa  209  4e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2094  hypothetical protein  42.11 
 
 
300 aa  206  2e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3217  hypothetical protein  44.31 
 
 
259 aa  204  9e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.984934  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1596  hypothetical protein  38.11 
 
 
298 aa  186  4e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000245931  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4772  hypothetical protein  30.68 
 
 
500 aa  96.7  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1222  hypothetical protein  29.68 
 
 
784 aa  79.7  0.00000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0212041  normal  0.276466 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1276  hypothetical protein  29.68 
 
 
784 aa  78.6  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0797799  normal 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4184  hypothetical protein  26.85 
 
 
1909 aa  77.8  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0155  hypothetical protein  33 
 
 
591 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000390792 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0124  hypothetical protein  33 
 
 
591 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108457 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0037  hypothetical protein  33 
 
 
576 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>