27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1222 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1276  hypothetical protein  94.01 
 
 
784 aa  1490    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0797799  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1222  hypothetical protein  100 
 
 
784 aa  1608    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0212041  normal  0.276466 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0124  hypothetical protein  29.07 
 
 
591 aa  151  5e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108457 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0037  hypothetical protein  29.07 
 
 
576 aa  150  6e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0155  hypothetical protein  30.39 
 
 
591 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000390792 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4772  hypothetical protein  39.84 
 
 
500 aa  86.3  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06041  hypothetical protein  26 
 
 
293 aa  85.5  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4068  hypothetical protein  37.1 
 
 
266 aa  84.3  0.000000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3852  hypothetical protein  37.96 
 
 
260 aa  80.5  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03643  hypothetical protein  29.68 
 
 
262 aa  79.7  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000329012  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4184  hypothetical protein  34.29 
 
 
1909 aa  79  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2295  hypothetical protein  30.77 
 
 
249 aa  75.5  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.813808 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1596  hypothetical protein  28.48 
 
 
298 aa  71.2  0.00000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000245931  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2094  hypothetical protein  31.58 
 
 
300 aa  71.6  0.00000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1840  hypothetical protein  30.36 
 
 
262 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.109043  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3593  hypothetical protein  36.79 
 
 
266 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3002  hypothetical protein  31.88 
 
 
270 aa  67.8  0.0000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2518  hypothetical protein  35.35 
 
 
260 aa  67.4  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1896  hypothetical protein  35.35 
 
 
260 aa  66.2  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.154307  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2199  hypothetical protein  35.35 
 
 
260 aa  66.2  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.45244  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2228  hypothetical protein  30 
 
 
262 aa  65.5  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.303656  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2344  hypothetical protein  30 
 
 
262 aa  65.5  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.492885  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2079  hypothetical protein  31.2 
 
 
292 aa  65.1  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2119  hypothetical protein  30 
 
 
262 aa  65.1  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.516183  normal  0.876146 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3759  hypothetical protein  34.82 
 
 
260 aa  63.2  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.553951  hitchhiker  0.00446449 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3217  hypothetical protein  33.94 
 
 
259 aa  60.8  0.00000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.984934  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2131  hypothetical protein  30 
 
 
262 aa  57  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>