27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4772 on replicon NC_012855
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012855  Rpic12D_4772  hypothetical protein  100 
 
 		 500 aa  1021    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4184  hypothetical protein  35.32 
 
 		 1909 aa  120  4.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3852  hypothetical protein  34.51 
 
 		 260 aa  117  5e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1276  hypothetical protein  28.78 
 
 		 784 aa  112  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0797799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1840  hypothetical protein  35.86 
 
 		 262 aa  109  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.109043  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0155  hypothetical protein  47.52 
 
 		 591 aa  108  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000390792 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0037  hypothetical protein  47.52 
 
 		 576 aa  107  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0124  hypothetical protein  47.52 
 
 		 591 aa  107  5e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108457 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06041  hypothetical protein  33.08 
 
 		 293 aa  107  5e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4068  hypothetical protein  30.97 
 
 		 266 aa  102  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1896  hypothetical protein  33.85 
 
 		 260 aa  102  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.154307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2079  hypothetical protein  34.21 
 
 		 292 aa  101  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2518  hypothetical protein  34.13 
 
 		 260 aa  100  5e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2295  hypothetical protein  31.85 
 
 		 249 aa  100  6e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.813808 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2228  hypothetical protein  34.11 
 
 		 262 aa  100  6e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.303656  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2344  hypothetical protein  34.11 
 
 		 262 aa  100  6e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.492885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3002  hypothetical protein  30.8 
 
 		 270 aa  99.8  9e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2199  hypothetical protein  33.59 
 
 		 260 aa  99.8  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.45244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2094  hypothetical protein  29.96 
 
 		 300 aa  99.4  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2119  hypothetical protein  33.2 
 
 		 262 aa  97.1  7e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.516183  normal  0.876146 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03643  hypothetical protein  30.68 
 
 		 262 aa  96.7  9e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000329012  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3217  hypothetical protein  30.35 
 
 		 259 aa  91.7  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.984934  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3759  hypothetical protein  29.23 
 
 		 260 aa  90.1  9e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.553951  hitchhiker  0.00446449 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1596  hypothetical protein  29.51 
 
 		 298 aa  89.7  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000245931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3593  hypothetical protein  31.6 
 
 		 266 aa  88.2  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1222  hypothetical protein  39.84 
 
 		 784 aa  86.3  0.000000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0212041  normal  0.276466 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2131  hypothetical protein  33.98 
 
 		 262 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>