27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2518 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2518  hypothetical protein  100 
 
 		 260 aa  536  9.999999999999999e-153  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1896  hypothetical protein  93.85 
 
 		 260 aa  508  1e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.154307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2079  hypothetical protein  93.08 
 
 		 292 aa  502  1e-141  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2199  hypothetical protein  92.69 
 
 		 260 aa  501  1e-141  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.45244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2344  hypothetical protein  81.01 
 
 		 262 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.492885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2228  hypothetical protein  81.4 
 
 		 262 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.303656  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2119  hypothetical protein  80.62 
 
 		 262 aa  441  1e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.516183  normal  0.876146 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1840  hypothetical protein  82.17 
 
 		 262 aa  442  1e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.109043  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2131  hypothetical protein  80.62 
 
 		 262 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3593  hypothetical protein  68.46 
 
 		 266 aa  371  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3759  hypothetical protein  65.23 
 
 		 260 aa  348  5e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.553951  hitchhiker  0.00446449 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3217  hypothetical protein  66.28 
 
 		 259 aa  347  1e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.984934  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2094  hypothetical protein  59.17 
 
 		 300 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3002  hypothetical protein  61.15 
 
 		 270 aa  326  2.0000000000000001e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06041  hypothetical protein  58.69 
 
 		 293 aa  296  2e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1596  hypothetical protein  54.86 
 
 		 298 aa  294  1e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000245931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03643  hypothetical protein  48.25 
 
 		 262 aa  239  2e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000329012  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4068  hypothetical protein  46.46 
 
 		 266 aa  218  6e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3852  hypothetical protein  44.8 
 
 		 260 aa  203  2e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2295  hypothetical protein  44.03 
 
 		 249 aa  192  6e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.813808 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4772  hypothetical protein  34.13 
 
 		 500 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4184  hypothetical protein  31.15 
 
 		 1909 aa  97.1  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0124  hypothetical protein  27.06 
 
 		 591 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108457 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0037  hypothetical protein  27.06 
 
 		 576 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1276  hypothetical protein  35.35 
 
 		 784 aa  67.4  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0797799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1222  hypothetical protein  35.35 
 
 		 784 aa  67  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0212041  normal  0.276466 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0155  hypothetical protein  36.36 
 
 		 591 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000390792 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>