27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3217 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_3217  hypothetical protein  100 
 
 
259 aa  537  9.999999999999999e-153  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.984934  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3593  hypothetical protein  78.76 
 
 
266 aa  422  1e-117  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3759  hypothetical protein  74.9 
 
 
260 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.553951  hitchhiker  0.00446449 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3002  hypothetical protein  69.5 
 
 
270 aa  383  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2119  hypothetical protein  65.5 
 
 
262 aa  354  8.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.516183  normal  0.876146 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2344  hypothetical protein  65.12 
 
 
262 aa  351  8e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.492885  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2228  hypothetical protein  65.12 
 
 
262 aa  350  1e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.303656  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2518  hypothetical protein  66.28 
 
 
260 aa  347  1e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1840  hypothetical protein  66.28 
 
 
262 aa  346  2e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.109043  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1896  hypothetical protein  65.89 
 
 
260 aa  345  3e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.154307  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2079  hypothetical protein  65.5 
 
 
292 aa  342  4e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2199  hypothetical protein  65.12 
 
 
260 aa  341  7e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.45244  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2131  hypothetical protein  65.5 
 
 
262 aa  334  1e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2094  hypothetical protein  56.14 
 
 
300 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06041  hypothetical protein  58.94 
 
 
293 aa  308  4e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1596  hypothetical protein  51.42 
 
 
298 aa  278  6e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000245931  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03643  hypothetical protein  44.31 
 
 
262 aa  204  8e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000329012  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4068  hypothetical protein  45.24 
 
 
266 aa  199  5e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3852  hypothetical protein  41.67 
 
 
260 aa  191  9e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2295  hypothetical protein  40.74 
 
 
249 aa  167  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.813808 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4184  hypothetical protein  31.17 
 
 
1909 aa  96.7  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4772  hypothetical protein  30.35 
 
 
500 aa  91.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0037  hypothetical protein  32.76 
 
 
576 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0124  hypothetical protein  32.76 
 
 
591 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108457 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0155  hypothetical protein  25.44 
 
 
591 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000390792 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1276  hypothetical protein  32.79 
 
 
784 aa  61.2  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0797799  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1222  hypothetical protein  33.94 
 
 
784 aa  60.8  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0212041  normal  0.276466 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>