102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3123 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_3123  FeoA family protein  100 
 
 
89 aa  176  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000148357 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1531  FeoA family protein  79.78 
 
 
84 aa  142  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.623664  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2691  FeoA family protein  81.58 
 
 
79 aa  130  9e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.537958  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1783  ferrous iron transport protein A  76.62 
 
 
79 aa  123  7e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2505  FeoA family protein  75.32 
 
 
79 aa  123  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0349064  hitchhiker  0.000844655 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2573  FeoA family protein  75.32 
 
 
79 aa  123  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0759459  normal  0.0205228 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2671  FeoA family protein  75.32 
 
 
79 aa  123  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0197296  normal  0.0682594 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1480  FeoA family protein  75.32 
 
 
79 aa  123  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.112925  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1594  FeoA family protein  75.32 
 
 
79 aa  119  9e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000124713  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1583  FeoA family protein  75.32 
 
 
79 aa  119  9e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000705378  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2760  FeoA family protein  75.32 
 
 
79 aa  119  9e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0428224  hitchhiker  0.000240658 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1617  FeoA family protein  76.32 
 
 
79 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000560013  normal  0.968592 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2518  FeoA family protein  76 
 
 
79 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.169172  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1214  ferrous iron transport protein A  74.36 
 
 
84 aa  117  6e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.160978  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2617  FeoA family protein  72.97 
 
 
79 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.838447  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2415  hypothetical protein  68.92 
 
 
79 aa  114  5e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0462693  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01363  hypothetical protein  42.11 
 
 
75 aa  65.1  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3854  Fe2+ transport system protein B-like protein  44.16 
 
 
117 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.746971 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0433  FeoA family protein  40.26 
 
 
143 aa  60.1  0.000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0238  ferrous iron transport protein A  40.79 
 
 
89 aa  60.1  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1960  ferrous iron transport protein A  40.79 
 
 
78 aa  59.7  0.00000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1665  ferrous iron transport protein A  38.46 
 
 
76 aa  59.3  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22720  ferrous iron transport protein A  44.16 
 
 
75 aa  58.5  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2257  ferrous iron transport protein FeoA  37.33 
 
 
75 aa  56.6  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0168  hypothetical protein  45.16 
 
 
110 aa  55.5  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2075  ferrous iron transport protein A  40.26 
 
 
97 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.874306 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0792  FeoA family protein  41.33 
 
 
76 aa  55.5  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0868788  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1819  ferrous iron transport protein A  40 
 
 
79 aa  54.7  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.253417  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0466  FeoA family protein  40 
 
 
79 aa  54.7  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0106  FeoA family protein  37.18 
 
 
84 aa  53.9  0.0000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3828  FeoA family protein  37.33 
 
 
71 aa  53.5  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.902982 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0972  FeoA family protein  40.51 
 
 
81 aa  53.1  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000216007  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2585  ferrous iron transporter A  33.77 
 
 
75 aa  52.4  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0974  FeoA family protein  36.99 
 
 
106 aa  52.8  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0128498  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2844  FeoA family protein  36.36 
 
 
88 aa  52  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2712  ferrous iron transporter A  32.47 
 
 
75 aa  50.8  0.000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2469  hypothetical protein  34.15 
 
 
81 aa  48.9  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16120  ferrous iron transporter FeoB  37.66 
 
 
785 aa  49.3  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000453744 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004104  ferrous iron transport protein A  42.55 
 
 
47 aa  48.9  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4104  FeoA family protein  36.99 
 
 
77 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.418864  normal  0.543833 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2566  FeoA family protein  37.33 
 
 
74 aa  48.5  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1341  hypothetical protein  34.38 
 
 
80 aa  48.1  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.932772  normal  0.0916633 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3659  FeoA family protein  33.33 
 
 
75 aa  48.1  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1193  FeoA family protein  44.44 
 
 
73 aa  47.8  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0972  ferrous iron repressor  42.37 
 
 
72 aa  47.4  0.00006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0428442  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0645  FeoA family protein  30.67 
 
 
74 aa  47.4  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.967049  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1127  ferrous iron transport protein A  45.1 
 
 
72 aa  47.4  0.00007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00351255  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4235  FeoA family protein  40.62 
 
 
74 aa  47.4  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.679143  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0872  FeoA family protein  38.67 
 
 
79 aa  47  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2435  FeoA family protein  33.33 
 
 
95 aa  47  0.00009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3766  FeoA family protein  33.33 
 
 
75 aa  47  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1930  ferrous iron transport protein A  36.49 
 
 
74 aa  46.6  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000000000534516  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0194  Fe2+ transport system protein A  37.5 
 
 
152 aa  46.6  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000592794  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1953  FeoA family protein  37.84 
 
 
80 aa  46.6  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000394964  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2465  FeoA family protein  35.06 
 
 
94 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3460  FeoA family protein  35.62 
 
 
73 aa  47  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000115859  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0653  Fe2+ transport system protein A  46.94 
 
 
158 aa  45.4  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0107  FeoA family protein  36.49 
 
 
97 aa  46.2  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0619  hypothetical protein  34.67 
 
 
73 aa  45.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000301048  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1786  FeoA family protein  32 
 
 
76 aa  46.2  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0221139  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2214  FeoA family protein  36.36 
 
 
96 aa  45.4  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1762  hypothetical protein  31.94 
 
 
76 aa  45.4  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0292  ferrous iron transport protein B  34.48 
 
 
784 aa  45.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000454012  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0097  iron dependent repressor, putative  38 
 
 
238 aa  44.7  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0071213  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0777  hypothetical protein  33.33 
 
 
82 aa  45.1  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.658901  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2325  ferrous iron transport protein B  35.53 
 
 
848 aa  45.1  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2072  FeoA family protein  35.53 
 
 
75 aa  44.7  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0961  FeoA family protein  39.06 
 
 
79 aa  44.3  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3411  FeoA family protein  32.88 
 
 
77 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0895  hypothetical protein  36.51 
 
 
76 aa  43.9  0.0008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.859474 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0622  FeoA family protein  35.9 
 
 
75 aa  43.9  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.927847 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0285  Fe2+ transport system protein A  42.55 
 
 
157 aa  43.5  0.0009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.621067  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1407  hypothetical protein  31.82 
 
 
82 aa  42.7  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3292  hypothetical protein  34.25 
 
 
77 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.27216  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0662  putative Fe2+ transport protein  29.33 
 
 
84 aa  42.7  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1932  FeoA family protein  36.07 
 
 
75 aa  43.5  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.373471  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0719  ferrous iron transport protein B  30.26 
 
 
829 aa  43.1  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0311256  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13000  Fe2+ transport system protein A  30.56 
 
 
73 aa  43.5  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0312741  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1450  ferrous iron transport protein A  36.54 
 
 
82 aa  42.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.348854  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0874  FeoA family protein  36.36 
 
 
154 aa  42.4  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000423206  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1089  FeoA family protein  33.33 
 
 
76 aa  42.4  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000327089  hitchhiker  0.0000000000000328537 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0633  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.94 
 
 
231 aa  42.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000139622  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2276  FeoA family protein  28.57 
 
 
84 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2064  ferrous iron transport protein A  31.17 
 
 
74 aa  41.6  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000130749  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0972  FeoA family protein  33.8 
 
 
94 aa  42  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0271378 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0896  FeoA family protein  36.36 
 
 
154 aa  41.6  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000698283  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0541  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.36 
 
 
207 aa  41.2  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000508383  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3778  ferrous iron transport protein A  34.48 
 
 
75 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3812  ferrous iron transport protein A  34.48 
 
 
75 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3703  ferrous iron transport protein A  34.48 
 
 
75 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3367  FeoA family protein  30.67 
 
 
77 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3706  ferrous iron transport protein A  34.48 
 
 
75 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3874  ferrous iron transport protein A  34.48 
 
 
75 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4588  putative ferrous iron transport protein A  27.14 
 
 
85 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1459  FeoA family protein  37.88 
 
 
75 aa  40.8  0.006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0291796  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0343  FeoA family protein  32.47 
 
 
78 aa  40.4  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0183501  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0745  FeoA family protein  33.77 
 
 
79 aa  40.4  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.445851 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4261  FeoA family protein  36.25 
 
 
84 aa  40.4  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.609569  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4628  ferrous iron transport protein A  38.24 
 
 
74 aa  40.4  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0109  FeoA family protein  35.85 
 
 
90 aa  40.4  0.008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000157937  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>