162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1665 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1665  ferrous iron transport protein A  100 
 
 
76 aa  149  2e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01363  hypothetical protein  73.33 
 
 
75 aa  108  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2257  ferrous iron transport protein FeoA  49.32 
 
 
75 aa  84.7  4e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004104  ferrous iron transport protein A  82.61 
 
 
47 aa  78.2  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2505  FeoA family protein  46.15 
 
 
79 aa  72  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0349064  hitchhiker  0.000844655 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2573  FeoA family protein  46.15 
 
 
79 aa  72  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0759459  normal  0.0205228 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2671  FeoA family protein  46.15 
 
 
79 aa  72  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0197296  normal  0.0682594 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1480  FeoA family protein  46.15 
 
 
79 aa  72  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.112925  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1783  ferrous iron transport protein A  44.87 
 
 
79 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2760  FeoA family protein  44.87 
 
 
79 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0428224  hitchhiker  0.000240658 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1594  FeoA family protein  44.87 
 
 
79 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000124713  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1583  FeoA family protein  44.87 
 
 
79 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000705378  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1617  FeoA family protein  44.87 
 
 
79 aa  68.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000560013  normal  0.968592 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0238  ferrous iron transport protein A  40.79 
 
 
89 aa  68.6  0.00000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1960  ferrous iron transport protein A  40.79 
 
 
78 aa  68.6  0.00000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1531  FeoA family protein  42.31 
 
 
84 aa  67  0.00000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.623664  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0433  FeoA family protein  37.84 
 
 
143 aa  65.5  0.0000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0974  FeoA family protein  47.62 
 
 
106 aa  64.7  0.0000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0128498  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1786  FeoA family protein  41.1 
 
 
76 aa  63.9  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0221139  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2518  FeoA family protein  38.46 
 
 
79 aa  62.4  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.169172  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1341  hypothetical protein  43.48 
 
 
80 aa  60.8  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.932772  normal  0.0916633 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2415  hypothetical protein  39.19 
 
 
79 aa  60.8  0.000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0462693  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2617  FeoA family protein  40.54 
 
 
79 aa  60.8  0.000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.838447  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22720  ferrous iron transport protein A  39.19 
 
 
75 aa  59.7  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0194  Fe2+ transport system protein A  41.43 
 
 
152 aa  58.5  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000592794  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2691  FeoA family protein  39.74 
 
 
79 aa  58.5  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.537958  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0872  FeoA family protein  40.79 
 
 
79 aa  58.5  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2566  FeoA family protein  41.67 
 
 
74 aa  57.8  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1214  ferrous iron transport protein A  36.49 
 
 
84 aa  57.4  0.00000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.160978  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2469  hypothetical protein  35.62 
 
 
81 aa  57  0.00000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0168  hypothetical protein  33.33 
 
 
110 aa  56.2  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3659  FeoA family protein  40 
 
 
75 aa  56.6  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0792  FeoA family protein  36.99 
 
 
76 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0868788  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0633  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  40.32 
 
 
231 aa  55.1  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000139622  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0106  FeoA family protein  33.33 
 
 
84 aa  55.5  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3766  FeoA family protein  38.67 
 
 
75 aa  54.7  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0097  iron dependent repressor, putative  36.62 
 
 
238 aa  54.3  0.0000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0071213  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3828  FeoA family protein  43.84 
 
 
71 aa  54.3  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.902982 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3854  Fe2+ transport system protein B-like protein  38.36 
 
 
117 aa  54.7  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.746971 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1971  FeoA family protein  34.25 
 
 
86 aa  53.9  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0237641  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1953  FeoA family protein  39.44 
 
 
80 aa  53.9  0.0000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000394964  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4104  FeoA family protein  40.85 
 
 
77 aa  53.9  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.418864  normal  0.543833 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1912  putative ferrous iron transport protein  40 
 
 
81 aa  53.5  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00246631  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3123  FeoA family protein  40 
 
 
89 aa  53.5  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000148357 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1435  hypothetical protein  38.03 
 
 
84 aa  52.4  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000347504  normal  0.0226993 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03985  probable ferrous iron transport protein A  35.21 
 
 
76 aa  52.8  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1630  feoA protein  40 
 
 
83 aa  52.8  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000000794157  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0972  FeoA family protein  37.14 
 
 
81 aa  52.4  0.000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000216007  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1750  FeoA family protein  37.33 
 
 
82 aa  52  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000170753  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16120  ferrous iron transporter FeoB  34.25 
 
 
785 aa  51.6  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000453744 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3460  FeoA family protein  35.21 
 
 
73 aa  51.6  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000115859  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1819  ferrous iron transport protein A  34.25 
 
 
79 aa  51.2  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.253417  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0466  FeoA family protein  34.25 
 
 
79 aa  51.2  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3411  FeoA family protein  40.85 
 
 
77 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3367  FeoA family protein  39.44 
 
 
77 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3874  ferrous iron transport protein A  42.59 
 
 
75 aa  50.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3706  ferrous iron transport protein A  42.59 
 
 
75 aa  50.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1459  FeoA family protein  38.03 
 
 
75 aa  50.8  0.000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0291796  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3812  ferrous iron transport protein A  42.59 
 
 
75 aa  50.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3778  ferrous iron transport protein A  42.59 
 
 
75 aa  50.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2697  FeoA family protein  35.21 
 
 
76 aa  50.4  0.000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0855124  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3703  ferrous iron transport protein A  42.59 
 
 
75 aa  50.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2712  ferrous iron transporter A  28.38 
 
 
75 aa  50.4  0.000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2075  ferrous iron transport protein A  33.78 
 
 
97 aa  50.1  0.000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.874306 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03260  ferrous iron transport protein A  40.74 
 
 
75 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0305  FeoA family protein  40.74 
 
 
75 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4715  ferrous iron transport protein A  40.74 
 
 
75 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2585  ferrous iron transporter A  28.38 
 
 
75 aa  50.1  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1930  ferrous iron transport protein A  34.72 
 
 
74 aa  50.1  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000000000534516  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3725  ferrous iron transport protein A  41.27 
 
 
78 aa  49.7  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0961  FeoA family protein  36.49 
 
 
79 aa  50.1  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2325  ferrous iron transport protein B  29.17 
 
 
848 aa  49.7  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3605  ferrous iron transport protein A  40.74 
 
 
75 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3883  ferrous iron transport protein A  40.74 
 
 
75 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0305  ferrous iron transport protein A  40.74 
 
 
75 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0806192 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3689  ferrous iron transport protein A  40.74 
 
 
75 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.990042 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3789  ferrous iron transport protein A  40.74 
 
 
75 aa  49.7  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03212  hypothetical protein  40.74 
 
 
75 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1450  FeoA family protein  35.21 
 
 
75 aa  50.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.298241  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0719  ferrous iron transport protein B  30.67 
 
 
829 aa  50.1  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0311256  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2072  FeoA family protein  31.08 
 
 
75 aa  48.9  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0777  hypothetical protein  33.87 
 
 
82 aa  48.9  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.658901  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2844  FeoA family protein  30 
 
 
88 aa  48.9  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0292  ferrous iron transport protein B  31.94 
 
 
784 aa  49.7  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000454012  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1932  FeoA family protein  32 
 
 
75 aa  49.3  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.373471  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56690  ferrous iron transport protein A  44.68 
 
 
75 aa  48.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0107  FeoA family protein  32.86 
 
 
97 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0619  hypothetical protein  31.51 
 
 
73 aa  48.5  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000301048  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5085  FeoA family protein  41.67 
 
 
82 aa  48.5  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00192965  normal  0.334589 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4261  FeoA family protein  34.25 
 
 
84 aa  48.9  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.609569  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1193  FeoA family protein  33.8 
 
 
73 aa  48.5  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1267  FeoA family protein  39.73 
 
 
83 aa  48.9  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1089  FeoA family protein  40 
 
 
76 aa  48.9  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000327089  hitchhiker  0.0000000000000328537 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0317  FeoA family protein  36.62 
 
 
84 aa  48.1  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000585031  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3292  hypothetical protein  38.36 
 
 
77 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.27216  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0653  Fe2+ transport system protein A  35.71 
 
 
158 aa  48.1  0.00004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1450  ferrous iron transport protein A  32.39 
 
 
82 aa  47.8  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.348854  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3821  ferrous iron transport protein A  38.89 
 
 
75 aa  47.8  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.732277  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0745  FeoA family protein  35.14 
 
 
79 aa  47.8  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.445851 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3773  FeoA family protein  35.62 
 
 
82 aa  47.8  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>