114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2518 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2518  FeoA family protein  100 
 
 		 79 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.169172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2691  FeoA family protein  78.48 
 
 		 79 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.537958  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1783  ferrous iron transport protein A  74.36 
 
 		 79 aa  122  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1531  FeoA family protein  77.33 
 
 		 84 aa  122  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.623664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2505  FeoA family protein  73.08 
 
 		 79 aa  121  3e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0349064  hitchhiker  0.000844655 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2573  FeoA family protein  73.08 
 
 		 79 aa  121  3e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0759459  normal  0.0205228 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2671  FeoA family protein  73.08 
 
 		 79 aa  121  3e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0197296  normal  0.0682594 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1480  FeoA family protein  73.08 
 
 		 79 aa  121  3e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.112925  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1594  FeoA family protein  73.08 
 
 		 79 aa  120  8e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000124713  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1583  FeoA family protein  73.08 
 
 		 79 aa  120  8e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000705378  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2760  FeoA family protein  73.08 
 
 		 79 aa  120  8e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0428224  hitchhiker  0.000240658 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2617  FeoA family protein  71.79 
 
 		 79 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.838447  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1617  FeoA family protein  73.08 
 
 		 79 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000560013  normal  0.968592 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2415  hypothetical protein  64.1 
 
 		 79 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0462693  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1214  ferrous iron transport protein A  73.33 
 
 		 84 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.160978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3123  FeoA family protein  75 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000148357 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01363  hypothetical protein  42.86 
 
 		 75 aa  65.5  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2257  ferrous iron transport protein FeoA  40 
 
 		 75 aa  64.7  0.0000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1665  ferrous iron transport protein A  38.46 
 
 		 76 aa  62.4  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0974  FeoA family protein  38.36 
 
 		 106 aa  59.7  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0128498  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0433  FeoA family protein  38.67 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0238  ferrous iron transport protein A  38.67 
 
 		 89 aa  57.4  0.00000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1960  ferrous iron transport protein A  38.67 
 
 		 78 aa  57.4  0.00000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3854  Fe2+ transport system protein B-like protein  42.67 
 
 		 117 aa  57.4  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.746971 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0106  FeoA family protein  39.74 
 
 		 84 aa  56.6  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0168  hypothetical protein  52 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2075  ferrous iron transport protein A  41.77 
 
 		 97 aa  53.9  0.0000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.874306 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1341  hypothetical protein  41.03 
 
 		 80 aa  53.9  0.0000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.932772  normal  0.0916633 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2585  ferrous iron transporter A  37.33 
 
 		 75 aa  53.5  0.0000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2712  ferrous iron transporter A  37.33 
 
 		 75 aa  53.5  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0653  Fe2+ transport system protein A  41.67 
 
 		 158 aa  53.5  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0792  FeoA family protein  37.66 
 
 		 76 aa  53.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0868788  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0872  FeoA family protein  41.03 
 
 		 79 aa  52.8  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2469  hypothetical protein  37.33 
 
 		 81 aa  52.4  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1127  ferrous iron transport protein A  47.17 
 
 		 72 aa  52  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00351255  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0972  ferrous iron repressor  47.17 
 
 		 72 aa  52  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0428442  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0107  FeoA family protein  41.67 
 
 		 97 aa  52.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4261  FeoA family protein  44 
 
 		 84 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.609569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2844  FeoA family protein  39.19 
 
 		 88 aa  52.4  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1930  ferrous iron transport protein A  36.49 
 
 		 74 aa  52  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000000000534516  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1193  FeoA family protein  52 
 
 		 73 aa  52  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22720  ferrous iron transport protein A  38.67 
 
 		 75 aa  52  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3766  FeoA family protein  37.66 
 
 		 75 aa  51.6  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13000  Fe2+ transport system protein A  39.13 
 
 		 73 aa  51.6  0.000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0312741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3659  FeoA family protein  37.66 
 
 		 75 aa  51.2  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1953  FeoA family protein  35.53 
 
 		 80 aa  50.8  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000394964  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0972  FeoA family protein  36.84 
 
 		 81 aa  50.8  0.000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000216007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4104  FeoA family protein  37.33 
 
 		 77 aa  50.4  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.418864  normal  0.543833 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1819  ferrous iron transport protein A  37.33 
 
 		 79 aa  50.4  0.000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.253417  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0466  FeoA family protein  37.33 
 
 		 79 aa  50.4  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3292  hypothetical protein  36.84 
 
 		 77 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.27216  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0777  hypothetical protein  36.99 
 
 		 82 aa  49.7  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.658901  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0194  Fe2+ transport system protein A  41.89 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000592794  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2435  FeoA family protein  38.36 
 
 		 95 aa  48.9  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1786  FeoA family protein  33.77 
 
 		 76 aa  49.3  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0221139  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2566  FeoA family protein  36.99 
 
 		 74 aa  48.9  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0292  ferrous iron transport protein B  39.19 
 
 		 784 aa  48.9  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000454012  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16120  ferrous iron transporter FeoB  36 
 
 		 785 aa  49.3  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000453744 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0552  FeoA family protein  38.67 
 
 		 84 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2465  FeoA family protein  42.03 
 
 		 94 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0622  FeoA family protein  42.67 
 
 		 75 aa  47.4  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.927847 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004104  ferrous iron transport protein A  42.22 
 
 		 47 aa  47.4  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3460  FeoA family protein  37.84 
 
 		 73 aa  47.4  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000115859  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0285  Fe2+ transport system protein A  44.68 
 
 		 157 aa  47  0.00009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.621067  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0619  hypothetical protein  42 
 
 		 73 aa  47  0.00009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000301048  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1089  FeoA family protein  35.59 
 
 		 76 aa  47  0.00009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000327089  hitchhiker  0.0000000000000328537 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0961  FeoA family protein  40.54 
 
 		 79 aa  46.6  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2214  FeoA family protein  38.67 
 
 		 96 aa  46.2  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0633  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.06 
 
 		 231 aa  46.2  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000139622  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0570  FeoA family protein  35.71 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.157552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0645  FeoA family protein  29.33 
 
 		 74 aa  47  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.967049  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3828  FeoA family protein  34.67 
 
 		 71 aa  46.2  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.902982 
 
 
-
 
NC_002936  DET0097  iron dependent repressor, putative  35.14 
 
 		 238 aa  45.8  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0071213  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1450  ferrous iron transport protein A  36.92 
 
 		 82 aa  46.2  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.348854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2276  FeoA family protein  32.47 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0972  FeoA family protein  35.71 
 
 		 94 aa  45.4  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0271378 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2325  ferrous iron transport protein B  31.51 
 
 		 848 aa  45.1  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2064  ferrous iron transport protein A  33.33 
 
 		 74 aa  44.7  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000130749  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1459  FeoA family protein  40.82 
 
 		 75 aa  44.7  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0291796  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20060  Fe2+ transport system protein A  42.31 
 
 		 81 aa  44.7  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.200768  normal  0.638087 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0783  ferrous iron transport protein A, putative  30 
 
 		 85 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0130272  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0680  ferrous iron transport protein A  30 
 
 		 85 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0624  ferrous iron transport protein A  30 
 
 		 85 aa  44.3  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0624  ferrous iron transport protein A  30 
 
 		 85 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000493594  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0714  ferrous iron transport protein A  30 
 
 		 85 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0343  FeoA family protein  36 
 
 		 78 aa  44.3  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0183501  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0843  putative ferrous iron transport protein A  30 
 
 		 85 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.923464  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0769  putative ferrous iron transport protein A  30 
 
 		 85 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000079809 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2072  FeoA family protein  38.46 
 
 		 75 aa  44.3  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03985  probable ferrous iron transport protein A  33.78 
 
 		 76 aa  43.9  0.0008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2724  FeoA family protein  32.89 
 
 		 75 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000395552  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0749  putative ferrous iron transport protein A  30 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4588  putative ferrous iron transport protein A  28.57 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1294  ferrous iron transport protein B  36.36 
 
 		 844 aa  42.4  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0719  ferrous iron transport protein B  30.67 
 
 		 829 aa  42.7  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0311256  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0874  FeoA family protein  34.18 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000423206  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0896  FeoA family protein  34.18 
 
 		 154 aa  42.4  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000698283  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3773  FeoA family protein  33.33 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3411  FeoA family protein  32 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1932  FeoA family protein  36.54 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.373471  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>