83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1214 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_1214  ferrous iron transport protein A  100 
 
 
84 aa  169  2e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.160978  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2617  FeoA family protein  77.03 
 
 
79 aa  123  8.000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.838447  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1783  ferrous iron transport protein A  78.38 
 
 
79 aa  122  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2505  FeoA family protein  77.03 
 
 
79 aa  122  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0349064  hitchhiker  0.000844655 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2573  FeoA family protein  77.03 
 
 
79 aa  122  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0759459  normal  0.0205228 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2671  FeoA family protein  77.03 
 
 
79 aa  122  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0197296  normal  0.0682594 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1480  FeoA family protein  77.03 
 
 
79 aa  122  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.112925  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1583  FeoA family protein  77.03 
 
 
79 aa  118  3e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000705378  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1594  FeoA family protein  77.03 
 
 
79 aa  118  3e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000124713  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2760  FeoA family protein  77.03 
 
 
79 aa  118  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0428224  hitchhiker  0.000240658 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1617  FeoA family protein  77.03 
 
 
79 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000560013  normal  0.968592 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2415  hypothetical protein  71.62 
 
 
79 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0462693  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2691  FeoA family protein  74.32 
 
 
79 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.537958  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2518  FeoA family protein  73.33 
 
 
79 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.169172  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1531  FeoA family protein  70.51 
 
 
84 aa  114  5e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.623664  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3123  FeoA family protein  76.39 
 
 
89 aa  110  4.0000000000000004e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000148357 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01363  hypothetical protein  38.67 
 
 
75 aa  58.2  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2257  ferrous iron transport protein FeoA  37.84 
 
 
75 aa  57.8  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1665  ferrous iron transport protein A  36.49 
 
 
76 aa  57.4  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0433  FeoA family protein  38.96 
 
 
143 aa  55.5  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2469  hypothetical protein  35.44 
 
 
81 aa  55.1  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1960  ferrous iron transport protein A  41.54 
 
 
78 aa  54.3  0.0000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0974  FeoA family protein  38.36 
 
 
106 aa  54.7  0.0000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0128498  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0238  ferrous iron transport protein A  41.54 
 
 
89 aa  54.3  0.0000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16120  ferrous iron transporter FeoB  37.97 
 
 
785 aa  54.3  0.0000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000453744 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3854  Fe2+ transport system protein B-like protein  37.97 
 
 
117 aa  54.3  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.746971 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2075  ferrous iron transport protein A  40.26 
 
 
97 aa  53.5  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.874306 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0106  FeoA family protein  37.04 
 
 
84 aa  52.4  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2585  ferrous iron transporter A  36.92 
 
 
75 aa  52.4  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0168  hypothetical protein  38.16 
 
 
110 aa  52  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2712  ferrous iron transporter A  35.38 
 
 
75 aa  50.8  0.000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22720  ferrous iron transport protein A  37.33 
 
 
75 aa  49.7  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2844  FeoA family protein  40 
 
 
88 aa  49.3  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0292  ferrous iron transport protein B  35.9 
 
 
784 aa  48.5  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000454012  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4261  FeoA family protein  39.24 
 
 
84 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.609569  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1341  hypothetical protein  33.78 
 
 
80 aa  48.5  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.932772  normal  0.0916633 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0777  hypothetical protein  33.77 
 
 
82 aa  48.1  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.658901  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0653  Fe2+ transport system protein A  37.5 
 
 
158 aa  48.1  0.00004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0872  FeoA family protein  38.46 
 
 
79 aa  48.1  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0961  FeoA family protein  38.16 
 
 
79 aa  47.4  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0633  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.68 
 
 
231 aa  47.4  0.00007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000139622  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2465  FeoA family protein  38.96 
 
 
94 aa  47.4  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2435  FeoA family protein  36.99 
 
 
95 aa  47  0.00008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0466  FeoA family protein  32.91 
 
 
79 aa  46.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1450  ferrous iron transport protein A  37.74 
 
 
82 aa  46.6  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.348854  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1819  ferrous iron transport protein A  32.91 
 
 
79 aa  46.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.253417  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0792  FeoA family protein  35.9 
 
 
76 aa  46.2  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0868788  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3828  FeoA family protein  40.28 
 
 
71 aa  46.6  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.902982 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0972  ferrous iron repressor  53.06 
 
 
72 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0428442  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2214  FeoA family protein  40 
 
 
96 aa  45.8  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3773  FeoA family protein  36.99 
 
 
82 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1127  ferrous iron transport protein A  53.06 
 
 
72 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00351255  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0972  FeoA family protein  37.5 
 
 
81 aa  45.4  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000216007  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0285  Fe2+ transport system protein A  38.16 
 
 
157 aa  45.4  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.621067  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2566  FeoA family protein  35.62 
 
 
74 aa  45.4  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0895  hypothetical protein  34.38 
 
 
76 aa  45.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.859474 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3460  FeoA family protein  50 
 
 
73 aa  44.7  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000115859  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1930  ferrous iron transport protein A  37.84 
 
 
74 aa  44.3  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000000000534516  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0552  FeoA family protein  34.18 
 
 
84 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2325  ferrous iron transport protein B  33.33 
 
 
848 aa  44.3  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0107  FeoA family protein  37.84 
 
 
97 aa  44.3  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3659  FeoA family protein  32 
 
 
75 aa  43.9  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004104  ferrous iron transport protein A  40 
 
 
47 aa  43.9  0.0008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1407  hypothetical protein  31.58 
 
 
82 aa  43.5  0.0009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1953  FeoA family protein  35.62 
 
 
80 aa  43.5  0.0009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000394964  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0972  FeoA family protein  42 
 
 
94 aa  43.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0271378 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0645  FeoA family protein  28 
 
 
74 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.967049  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2072  FeoA family protein  36.11 
 
 
75 aa  43.1  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1193  FeoA family protein  44.9 
 
 
73 aa  43.5  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3725  ferrous iron transport protein A  40 
 
 
78 aa  42.7  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1459  FeoA family protein  46.15 
 
 
75 aa  42.4  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0291796  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13000  Fe2+ transport system protein A  34.78 
 
 
73 aa  42.4  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0312741  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1089  FeoA family protein  41.67 
 
 
76 aa  42.4  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000327089  hitchhiker  0.0000000000000328537 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3766  FeoA family protein  32 
 
 
75 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0902  FeoA family protein  35.94 
 
 
76 aa  42.4  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0959583  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1786  FeoA family protein  32.43 
 
 
76 aa  42.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0221139  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0619  hypothetical protein  37.25 
 
 
73 aa  41.6  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000301048  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1932  FeoA family protein  41.3 
 
 
75 aa  41.2  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.373471  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2064  ferrous iron transport protein A  32.47 
 
 
74 aa  40.8  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000130749  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4104  FeoA family protein  33.77 
 
 
77 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.418864  normal  0.543833 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03985  probable ferrous iron transport protein A  30.67 
 
 
76 aa  40.8  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0570  FeoA family protein  39.44 
 
 
78 aa  40  0.01  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.157552  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4235  FeoA family protein  31.25 
 
 
74 aa  40  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.679143  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>