115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2505 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_2505  FeoA family protein  100 
 
 		 79 aa  155  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0349064  hitchhiker  0.000844655 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2573  FeoA family protein  100 
 
 		 79 aa  155  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0759459  normal  0.0205228 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2671  FeoA family protein  100 
 
 		 79 aa  155  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0197296  normal  0.0682594 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1480  FeoA family protein  100 
 
 		 79 aa  155  1e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.112925  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1783  ferrous iron transport protein A  98.73 
 
 		 79 aa  154  4e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1594  FeoA family protein  96.2 
 
 		 79 aa  150  4e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000124713  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1583  FeoA family protein  96.2 
 
 		 79 aa  150  4e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000705378  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2760  FeoA family protein  96.2 
 
 		 79 aa  150  4e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0428224  hitchhiker  0.000240658 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1617  FeoA family protein  96.2 
 
 		 79 aa  150  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000560013  normal  0.968592 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2691  FeoA family protein  85.9 
 
 		 79 aa  136  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.537958  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2617  FeoA family protein  83.54 
 
 		 79 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.838447  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2415  hypothetical protein  75.95 
 
 		 79 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0462693  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1531  FeoA family protein  74.7 
 
 		 84 aa  124  5e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.623664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1214  ferrous iron transport protein A  77.03 
 
 		 84 aa  122  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.160978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2518  FeoA family protein  73.08 
 
 		 79 aa  121  3e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.169172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3123  FeoA family protein  76.39 
 
 		 89 aa  115  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000148357 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1665  ferrous iron transport protein A  46.15 
 
 		 76 aa  72  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01363  hypothetical protein  44.16 
 
 		 75 aa  65.1  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2257  ferrous iron transport protein FeoA  35.53 
 
 		 75 aa  62.8  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0974  FeoA family protein  41.1 
 
 		 106 aa  61.6  0.000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0128498  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0238  ferrous iron transport protein A  37.97 
 
 		 89 aa  61.6  0.000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1960  ferrous iron transport protein A  37.97 
 
 		 78 aa  61.2  0.000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0168  hypothetical protein  37.18 
 
 		 110 aa  58.5  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0106  FeoA family protein  36.25 
 
 		 84 aa  58.5  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0433  FeoA family protein  36.84 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3854  Fe2+ transport system protein B-like protein  39.47 
 
 		 117 aa  57  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.746971 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2585  ferrous iron transporter A  36.84 
 
 		 75 aa  56.2  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22720  ferrous iron transport protein A  42.11 
 
 		 75 aa  56.6  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2712  ferrous iron transporter A  35.53 
 
 		 75 aa  54.7  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1341  hypothetical protein  38.67 
 
 		 80 aa  53.9  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.932772  normal  0.0916633 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2844  FeoA family protein  34.18 
 
 		 88 aa  53.1  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2075  ferrous iron transport protein A  38.16 
 
 		 97 aa  52.4  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.874306 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0872  FeoA family protein  35.9 
 
 		 79 aa  51.6  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2435  FeoA family protein  35.53 
 
 		 95 aa  51.6  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2469  hypothetical protein  36 
 
 		 81 aa  50.8  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3659  FeoA family protein  34.62 
 
 		 75 aa  50.4  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0097  iron dependent repressor, putative  36.99 
 
 		 238 aa  49.7  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0071213  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0653  Fe2+ transport system protein A  40.28 
 
 		 158 aa  49.7  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004104  ferrous iron transport protein A  44.68 
 
 		 47 aa  50.1  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0645  FeoA family protein  29.33 
 
 		 74 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.967049  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3828  FeoA family protein  36 
 
 		 71 aa  49.7  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.902982 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16120  ferrous iron transporter FeoB  36 
 
 		 785 aa  49.7  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000453744 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0792  FeoA family protein  37.33 
 
 		 76 aa  49.3  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0868788  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2214  FeoA family protein  34.18 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3766  FeoA family protein  34.62 
 
 		 75 aa  48.9  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2465  FeoA family protein  35.44 
 
 		 94 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1930  ferrous iron transport protein A  36.84 
 
 		 74 aa  48.1  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000000000534516  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2566  FeoA family protein  35.14 
 
 		 74 aa  47.8  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4104  FeoA family protein  35.62 
 
 		 77 aa  47.4  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.418864  normal  0.543833 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0777  hypothetical protein  35.14 
 
 		 82 aa  47.4  0.00007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.658901  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0107  FeoA family protein  34.18 
 
 		 97 aa  47.4  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0895  hypothetical protein  34.92 
 
 		 76 aa  46.6  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.859474 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1193  FeoA family protein  46 
 
 		 73 aa  46.6  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2072  FeoA family protein  32.89 
 
 		 75 aa  46.2  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1932  FeoA family protein  40 
 
 		 75 aa  46.2  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.373471  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2064  ferrous iron transport protein A  33.77 
 
 		 74 aa  45.8  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000130749  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1819  ferrous iron transport protein A  38 
 
 		 79 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.253417  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0466  FeoA family protein  38 
 
 		 79 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0874  FeoA family protein  34.67 
 
 		 154 aa  45.8  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000423206  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03985  probable ferrous iron transport protein A  33.33 
 
 		 76 aa  45.4  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1953  FeoA family protein  35.14 
 
 		 80 aa  45.4  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000394964  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1786  FeoA family protein  35.44 
 
 		 76 aa  46.2  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0221139  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0719  ferrous iron transport protein B  26.92 
 
 		 829 aa  46.2  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0311256  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1127  ferrous iron transport protein A  44.9 
 
 		 72 aa  45.1  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00351255  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0972  ferrous iron repressor  44.9 
 
 		 72 aa  45.1  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0428442  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4261  FeoA family protein  35.9 
 
 		 84 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.609569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0972  FeoA family protein  42 
 
 		 81 aa  45.1  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000216007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3411  FeoA family protein  34.25 
 
 		 77 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0961  FeoA family protein  39.73 
 
 		 79 aa  44.7  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0896  FeoA family protein  34.67 
 
 		 154 aa  44.7  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000698283  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0194  Fe2+ transport system protein A  37.5 
 
 		 152 aa  44.3  0.0005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000592794  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2325  ferrous iron transport protein B  29.87 
 
 		 848 aa  43.9  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1762  hypothetical protein  27.78 
 
 		 76 aa  43.5  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3292  hypothetical protein  32 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.27216  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2492  FeoA family protein  34.25 
 
 		 80 aa  42.7  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0619  hypothetical protein  35.29 
 
 		 73 aa  43.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000301048  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4235  FeoA family protein  31.82 
 
 		 74 aa  43.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.679143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1450  ferrous iron transport protein A  34.69 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.348854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2276  FeoA family protein  29.87 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0972  FeoA family protein  31.08 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0271378 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0260  FeoA family protein  37.33 
 
 		 158 aa  42.7  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00349383  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3778  ferrous iron transport protein A  28.38 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3812  ferrous iron transport protein A  28.38 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3703  ferrous iron transport protein A  28.38 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3367  FeoA family protein  32.88 
 
 		 77 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3706  ferrous iron transport protein A  28.38 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3874  ferrous iron transport protein A  28.38 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0292  ferrous iron transport protein B  30.38 
 
 		 784 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000454012  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3460  FeoA family protein  40 
 
 		 73 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000115859  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1971  FeoA family protein  28.75 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0237641  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1407  hypothetical protein  35.38 
 
 		 82 aa  42  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0285  Fe2+ transport system protein A  38.78 
 
 		 157 aa  41.6  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.621067  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0552  FeoA family protein  34.62 
 
 		 84 aa  41.6  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1267  FeoA family protein  34.62 
 
 		 83 aa  42  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1584  FeoA family protein  29.73 
 
 		 75 aa  42  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0109  FeoA family protein  35.85 
 
 		 90 aa  41.2  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000157937  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1089  FeoA family protein  30.51 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000327089  hitchhiker  0.0000000000000328537 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1446  FeoA family protein  32.43 
 
 		 81 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1472  FeoA family protein  32.43 
 
 		 81 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.805399 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0305  FeoA family protein  27.03 
 
 		 75 aa  40.8  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>