167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3854 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3854  Fe2+ transport system protein B-like protein  100 
 
 
117 aa  223  7e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.746971 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1819  ferrous iron transport protein A  72 
 
 
79 aa  111  3e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.253417  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0466  FeoA family protein  72 
 
 
79 aa  111  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0168  hypothetical protein  63.51 
 
 
110 aa  99  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22720  ferrous iron transport protein A  65.75 
 
 
75 aa  92.8  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2469  hypothetical protein  57.33 
 
 
81 aa  87.8  5e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0106  FeoA family protein  51.95 
 
 
84 aa  85.9  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0238  ferrous iron transport protein A  50.68 
 
 
89 aa  79.7  0.00000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1960  ferrous iron transport protein A  50.68 
 
 
78 aa  79.7  0.00000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2072  FeoA family protein  47.3 
 
 
75 aa  76.3  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1932  FeoA family protein  46.67 
 
 
75 aa  76.3  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.373471  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2566  FeoA family protein  52.11 
 
 
74 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1930  ferrous iron transport protein A  47.22 
 
 
74 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000000000534516  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2585  ferrous iron transporter A  44 
 
 
75 aa  68.2  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2712  ferrous iron transporter A  44 
 
 
75 aa  67.8  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0109  FeoA family protein  46.67 
 
 
90 aa  68.2  0.00000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000157937  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0433  FeoA family protein  44.16 
 
 
143 aa  68.2  0.00000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0107  FeoA family protein  47.22 
 
 
97 aa  67.8  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0541  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  44.87 
 
 
207 aa  67.8  0.00000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000508383  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3821  ferrous iron transport protein A  50.77 
 
 
75 aa  67  0.00000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.732277  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0872  FeoA family protein  47.95 
 
 
79 aa  67  0.00000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3778  ferrous iron transport protein A  49.25 
 
 
75 aa  66.6  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3703  ferrous iron transport protein A  49.25 
 
 
75 aa  66.6  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3812  ferrous iron transport protein A  49.25 
 
 
75 aa  66.6  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3874  ferrous iron transport protein A  49.25 
 
 
75 aa  66.6  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3706  ferrous iron transport protein A  49.25 
 
 
75 aa  66.6  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03260  ferrous iron transport protein A  49.25 
 
 
75 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0305  FeoA family protein  49.25 
 
 
75 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1450  ferrous iron transport protein A  46.48 
 
 
82 aa  66.2  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.348854  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2075  ferrous iron transport protein A  44 
 
 
97 aa  66.2  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.874306 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4715  ferrous iron transport protein A  49.25 
 
 
75 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3605  ferrous iron transport protein A  49.25 
 
 
75 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3883  ferrous iron transport protein A  49.25 
 
 
75 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03212  hypothetical protein  49.25 
 
 
75 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0305  ferrous iron transport protein A  49.25 
 
 
75 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0806192 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4235  FeoA family protein  66.67 
 
 
74 aa  66.2  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.679143  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3689  ferrous iron transport protein A  49.25 
 
 
75 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.990042 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3789  ferrous iron transport protein A  49.25 
 
 
75 aa  66.6  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20060  Fe2+ transport system protein A  41.56 
 
 
81 aa  65.9  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.200768  normal  0.638087 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0285  Fe2+ transport system protein A  42.47 
 
 
157 aa  65.5  0.0000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.621067  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0622  FeoA family protein  42.11 
 
 
75 aa  65.5  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.927847 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1341  hypothetical protein  40.54 
 
 
80 aa  64.7  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.932772  normal  0.0916633 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1446  FeoA family protein  45.33 
 
 
81 aa  64.3  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0570  FeoA family protein  44.29 
 
 
78 aa  64.3  0.0000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.157552  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1472  FeoA family protein  45.33 
 
 
81 aa  64.3  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.805399 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0972  FeoA family protein  41.89 
 
 
81 aa  63.9  0.0000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000216007  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4104  FeoA family protein  42.67 
 
 
77 aa  63.9  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.418864  normal  0.543833 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3292  hypothetical protein  45.59 
 
 
77 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.27216  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2465  FeoA family protein  45.33 
 
 
94 aa  63.5  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4628  ferrous iron transport protein A  46.77 
 
 
74 aa  63.5  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0753  FeoA family protein  44.74 
 
 
75 aa  62.8  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000372394  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3367  FeoA family protein  44.59 
 
 
77 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1531  FeoA family protein  41.56 
 
 
84 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.623664  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2691  FeoA family protein  42.11 
 
 
79 aa  62.4  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.537958  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2435  FeoA family protein  54.72 
 
 
95 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1127  ferrous iron transport protein A  46.3 
 
 
72 aa  61.6  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00351255  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0972  ferrous iron repressor  46.3 
 
 
72 aa  61.6  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0428442  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0974  FeoA family protein  45.07 
 
 
106 aa  62  0.000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0128498  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2214  FeoA family protein  44.74 
 
 
96 aa  61.6  0.000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3411  FeoA family protein  44.44 
 
 
77 aa  61.2  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1786  FeoA family protein  34.25 
 
 
76 aa  61.6  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0221139  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0792  FeoA family protein  41.1 
 
 
76 aa  60.8  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0868788  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1089  FeoA family protein  42.25 
 
 
76 aa  60.8  0.000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000327089  hitchhiker  0.0000000000000328537 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4930  ferrous iron transport protein A  49.15 
 
 
75 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0645  FeoA family protein  46.58 
 
 
74 aa  60.5  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.967049  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1953  FeoA family protein  43.66 
 
 
80 aa  60.5  0.000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000394964  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3123  FeoA family protein  45.83 
 
 
89 aa  60.5  0.000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000148357 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3984  ferrous iron transport protein A  44.26 
 
 
75 aa  60.1  0.000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3745  ferrous iron transport protein A  44.26 
 
 
75 aa  60.1  0.000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0169  ferrous iron transport protein A  44.26 
 
 
75 aa  60.1  0.000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0097  iron dependent repressor, putative  42.25 
 
 
238 aa  60.1  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0071213  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0777  hypothetical protein  51.02 
 
 
82 aa  60.1  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.658901  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13000  Fe2+ transport system protein A  50.98 
 
 
73 aa  59.7  0.00000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0312741  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1193  FeoA family protein  42.25 
 
 
73 aa  59.7  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2844  FeoA family protein  37.33 
 
 
88 aa  58.9  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56690  ferrous iron transport protein A  47.46 
 
 
75 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0194  Fe2+ transport system protein A  48.15 
 
 
152 aa  59.3  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000592794  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3543  FeoA family protein  52.73 
 
 
81 aa  58.9  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0619  hypothetical protein  42.25 
 
 
73 aa  58.9  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000301048  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0292  ferrous iron transport protein B  40 
 
 
784 aa  58.9  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000454012  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4261  FeoA family protein  45.61 
 
 
84 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.609569  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0972  FeoA family protein  42.11 
 
 
94 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0271378 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1435  hypothetical protein  43.24 
 
 
84 aa  57.8  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000347504  normal  0.0226993 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1783  ferrous iron transport protein A  40.79 
 
 
79 aa  57.8  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0745  FeoA family protein  36 
 
 
79 aa  57.8  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.445851 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2518  FeoA family protein  42.67 
 
 
79 aa  57.8  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.169172  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3460  FeoA family protein  40.85 
 
 
73 aa  57.4  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000115859  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2505  FeoA family protein  39.47 
 
 
79 aa  57  0.00000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0349064  hitchhiker  0.000844655 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2573  FeoA family protein  39.47 
 
 
79 aa  57  0.00000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0759459  normal  0.0205228 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2492  FeoA family protein  45.33 
 
 
80 aa  57  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2671  FeoA family protein  39.47 
 
 
79 aa  57  0.00000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0197296  normal  0.0682594 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1480  FeoA family protein  39.47 
 
 
79 aa  57  0.00000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.112925  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3659  FeoA family protein  35.62 
 
 
75 aa  56.2  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1459  FeoA family protein  41.07 
 
 
75 aa  56.6  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0291796  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01363  hypothetical protein  36.99 
 
 
75 aa  56.2  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0317  FeoA family protein  44.59 
 
 
84 aa  56.6  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000585031  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2257  ferrous iron transport protein FeoA  36 
 
 
75 aa  55.8  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2415  hypothetical protein  41.67 
 
 
79 aa  55.8  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0462693  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3725  ferrous iron transport protein A  38.24 
 
 
78 aa  55.8  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0857  hypothetical protein  36.36 
 
 
81 aa  55.5  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.577958  normal  0.227068 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>