97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2415 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_2415  hypothetical protein  100 
 
 
79 aa  160  7e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0462693  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2617  FeoA family protein  81.01 
 
 
79 aa  135  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.838447  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2671  FeoA family protein  75.95 
 
 
79 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0197296  normal  0.0682594 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2573  FeoA family protein  75.95 
 
 
79 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0759459  normal  0.0205228 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2505  FeoA family protein  75.95 
 
 
79 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0349064  hitchhiker  0.000844655 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1480  FeoA family protein  75.95 
 
 
79 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.112925  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1783  ferrous iron transport protein A  74.68 
 
 
79 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1617  FeoA family protein  73.42 
 
 
79 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000560013  normal  0.968592 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1594  FeoA family protein  73.42 
 
 
79 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000124713  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2760  FeoA family protein  73.42 
 
 
79 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0428224  hitchhiker  0.000240658 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1583  FeoA family protein  73.42 
 
 
79 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000705378  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2691  FeoA family protein  77.03 
 
 
79 aa  123  8.000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.537958  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1214  ferrous iron transport protein A  71.62 
 
 
84 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.160978  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1531  FeoA family protein  68.92 
 
 
84 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.623664  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2518  FeoA family protein  64.1 
 
 
79 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.169172  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3123  FeoA family protein  68.06 
 
 
89 aa  110  9e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000148357 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01363  hypothetical protein  41.89 
 
 
75 aa  61.6  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1665  ferrous iron transport protein A  39.19 
 
 
76 aa  60.8  0.000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2257  ferrous iron transport protein FeoA  37.84 
 
 
75 aa  60.1  0.000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0974  FeoA family protein  37.18 
 
 
106 aa  59.7  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0128498  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0238  ferrous iron transport protein A  43.28 
 
 
89 aa  57  0.00000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1960  ferrous iron transport protein A  39.19 
 
 
78 aa  57  0.00000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3854  Fe2+ transport system protein B-like protein  41.67 
 
 
117 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.746971 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2712  ferrous iron transporter A  38.46 
 
 
75 aa  54.7  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2585  ferrous iron transporter A  38.46 
 
 
75 aa  54.7  0.0000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0433  FeoA family protein  33.78 
 
 
143 aa  53.9  0.0000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0168  hypothetical protein  45.1 
 
 
110 aa  52.4  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22720  ferrous iron transport protein A  40.54 
 
 
75 aa  51.2  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2844  FeoA family protein  34.29 
 
 
88 aa  50.4  0.000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2469  hypothetical protein  36.49 
 
 
81 aa  50.4  0.000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0653  Fe2+ transport system protein A  39.19 
 
 
158 aa  49.7  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2214  FeoA family protein  36.99 
 
 
96 aa  48.9  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2465  FeoA family protein  37.68 
 
 
94 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2075  ferrous iron transport protein A  37.84 
 
 
97 aa  48.9  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.874306 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1786  FeoA family protein  34.21 
 
 
76 aa  47.4  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0221139  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1930  ferrous iron transport protein A  37.33 
 
 
74 aa  47.4  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000000000534516  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0895  hypothetical protein  38.57 
 
 
76 aa  47.4  0.00007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.859474 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0107  FeoA family protein  34.18 
 
 
97 aa  47  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0792  FeoA family protein  32.47 
 
 
76 aa  46.2  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0868788  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2435  FeoA family protein  34.67 
 
 
95 aa  46.2  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0097  iron dependent repressor, putative  35.14 
 
 
238 aa  46.6  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0071213  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0106  FeoA family protein  31.94 
 
 
84 aa  47  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1341  hypothetical protein  32.88 
 
 
80 aa  46.6  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.932772  normal  0.0916633 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0645  FeoA family protein  29.73 
 
 
74 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.967049  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0777  hypothetical protein  34.25 
 
 
82 aa  45.8  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.658901  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3828  FeoA family protein  34.72 
 
 
71 aa  45.8  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.902982 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0972  FeoA family protein  40.74 
 
 
81 aa  45.8  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000216007  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4104  FeoA family protein  32.89 
 
 
77 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.418864  normal  0.543833 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13000  Fe2+ transport system protein A  33.82 
 
 
73 aa  45.4  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0312741  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3659  FeoA family protein  31.17 
 
 
75 aa  45.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004104  ferrous iron transport protein A  40.91 
 
 
47 aa  45.1  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16120  ferrous iron transporter FeoB  33.78 
 
 
785 aa  44.7  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000453744 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1932  FeoA family protein  41.3 
 
 
75 aa  45.1  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.373471  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0292  ferrous iron transport protein B  32.91 
 
 
784 aa  44.3  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000454012  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0872  FeoA family protein  35.29 
 
 
79 aa  44.3  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2072  FeoA family protein  39.13 
 
 
75 aa  43.9  0.0008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0972  ferrous iron repressor  44.9 
 
 
72 aa  43.9  0.0008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0428442  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1127  ferrous iron transport protein A  44.9 
 
 
72 aa  43.9  0.0008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00351255  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3766  FeoA family protein  31.17 
 
 
75 aa  43.5  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1193  FeoA family protein  42.86 
 
 
73 aa  43.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1819  ferrous iron transport protein A  39.58 
 
 
79 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.253417  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0466  FeoA family protein  39.58 
 
 
79 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0783  ferrous iron transport protein A, putative  29.87 
 
 
85 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0130272  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0843  putative ferrous iron transport protein A  29.87 
 
 
85 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.923464  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0769  putative ferrous iron transport protein A  31.17 
 
 
85 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000079809 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3460  FeoA family protein  40.82 
 
 
73 aa  42.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000115859  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0874  FeoA family protein  33.77 
 
 
154 aa  42.4  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000423206  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0624  ferrous iron transport protein A  31.17 
 
 
85 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000493594  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0624  ferrous iron transport protein A  31.17 
 
 
85 aa  42.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1450  ferrous iron transport protein A  37.5 
 
 
82 aa  42.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.348854  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0714  ferrous iron transport protein A  31.17 
 
 
85 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1407  hypothetical protein  33.82 
 
 
82 aa  42.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0194  Fe2+ transport system protein A  41.18 
 
 
152 aa  42.7  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000592794  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0680  ferrous iron transport protein A  31.17 
 
 
85 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4261  FeoA family protein  32.43 
 
 
84 aa  42.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.609569  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0749  putative ferrous iron transport protein A  31.17 
 
 
85 aa  42  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0630  FeoA family protein  31.17 
 
 
85 aa  42  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2276  FeoA family protein  29.58 
 
 
84 aa  42  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1953  FeoA family protein  30.26 
 
 
80 aa  42  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000394964  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2492  FeoA family protein  34.18 
 
 
80 aa  42  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0285  Fe2+ transport system protein A  33.93 
 
 
157 aa  42  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.621067  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3812  ferrous iron transport protein A  31.43 
 
 
75 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3703  ferrous iron transport protein A  31.43 
 
 
75 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2325  ferrous iron transport protein B  31.94 
 
 
848 aa  41.6  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3778  ferrous iron transport protein A  31.43 
 
 
75 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3706  ferrous iron transport protein A  31.43 
 
 
75 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3874  ferrous iron transport protein A  31.43 
 
 
75 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0896  FeoA family protein  34.21 
 
 
154 aa  41.2  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000698283  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2566  FeoA family protein  31.94 
 
 
74 aa  41.6  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0972  FeoA family protein  31.88 
 
 
94 aa  41.6  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0271378 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4588  putative ferrous iron transport protein A  29.87 
 
 
85 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0619  hypothetical protein  34 
 
 
73 aa  41.2  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000301048  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0719  ferrous iron transport protein B  27.03 
 
 
829 aa  40.8  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0311256  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3821  ferrous iron transport protein A  31.43 
 
 
75 aa  40.8  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.732277  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0633  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.25 
 
 
231 aa  40.4  0.008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000139622  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0961  FeoA family protein  36.23 
 
 
79 aa  40.4  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1089  FeoA family protein  31.03 
 
 
76 aa  40  0.01  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000327089  hitchhiker  0.0000000000000328537 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>