162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2072 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_2072  FeoA family protein  100 
 
 
75 aa  148  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1932  FeoA family protein  90.54 
 
 
75 aa  135  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.373471  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2469  hypothetical protein  58.9 
 
 
81 aa  94.4  5e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22720  ferrous iron transport protein A  52 
 
 
75 aa  85.9  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0168  hypothetical protein  54.17 
 
 
110 aa  84  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0106  FeoA family protein  52.7 
 
 
84 aa  81.3  0.000000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3854  Fe2+ transport system protein B-like protein  47.3 
 
 
117 aa  77  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.746971 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2712  ferrous iron transporter A  46.67 
 
 
75 aa  74.7  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2585  ferrous iron transporter A  45.33 
 
 
75 aa  73.6  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1819  ferrous iron transport protein A  44.59 
 
 
79 aa  72.4  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.253417  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0466  FeoA family protein  44.59 
 
 
79 aa  72.4  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1450  ferrous iron transport protein A  44.44 
 
 
82 aa  70.1  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.348854  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0238  ferrous iron transport protein A  41.89 
 
 
89 aa  67  0.00000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1960  ferrous iron transport protein A  41.89 
 
 
78 aa  66.6  0.0000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2566  FeoA family protein  40.54 
 
 
74 aa  61.6  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0972  ferrous iron repressor  43.66 
 
 
72 aa  60.8  0.000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0428442  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1127  ferrous iron transport protein A  43.66 
 
 
72 aa  60.5  0.000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00351255  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0777  hypothetical protein  37.84 
 
 
82 aa  59.3  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.658901  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03260  ferrous iron transport protein A  41.18 
 
 
75 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0305  FeoA family protein  41.18 
 
 
75 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4715  ferrous iron transport protein A  41.18 
 
 
75 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20060  Fe2+ transport system protein A  40 
 
 
81 aa  58.5  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.200768  normal  0.638087 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0972  FeoA family protein  45.45 
 
 
81 aa  58.5  0.00000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000216007  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3605  ferrous iron transport protein A  41.18 
 
 
75 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3883  ferrous iron transport protein A  41.18 
 
 
75 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0305  ferrous iron transport protein A  41.18 
 
 
75 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0806192 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3689  ferrous iron transport protein A  41.18 
 
 
75 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.990042 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03212  hypothetical protein  41.18 
 
 
75 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3789  ferrous iron transport protein A  41.18 
 
 
75 aa  58.5  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1341  hypothetical protein  41.1 
 
 
80 aa  57.8  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.932772  normal  0.0916633 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1193  FeoA family protein  37.5 
 
 
73 aa  57.8  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3703  ferrous iron transport protein A  39.13 
 
 
75 aa  57.4  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3874  ferrous iron transport protein A  39.13 
 
 
75 aa  57.4  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3706  ferrous iron transport protein A  39.13 
 
 
75 aa  57.4  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0194  Fe2+ transport system protein A  48.94 
 
 
152 aa  57.8  0.00000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000592794  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3812  ferrous iron transport protein A  39.13 
 
 
75 aa  57.4  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0107  FeoA family protein  43.24 
 
 
97 aa  57.8  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3778  ferrous iron transport protein A  39.13 
 
 
75 aa  57.4  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0285  Fe2+ transport system protein A  46.43 
 
 
157 aa  57.4  0.00000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.621067  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3821  ferrous iron transport protein A  39.13 
 
 
75 aa  57.4  0.00000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.732277  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1089  FeoA family protein  48.15 
 
 
76 aa  57  0.00000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000327089  hitchhiker  0.0000000000000328537 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0633  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  48.39 
 
 
231 aa  57  0.00000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000139622  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1138  FeoA family protein  41.67 
 
 
80 aa  57  0.00000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000908458  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0872  FeoA family protein  45.95 
 
 
79 aa  56.6  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3460  FeoA family protein  41.67 
 
 
73 aa  57  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000115859  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1786  FeoA family protein  36.76 
 
 
76 aa  56.6  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0221139  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2214  FeoA family protein  40.54 
 
 
96 aa  55.8  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4628  ferrous iron transport protein A  42.19 
 
 
74 aa  56.2  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2075  ferrous iron transport protein A  38.67 
 
 
97 aa  55.5  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.874306 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0972  FeoA family protein  41.1 
 
 
94 aa  55.1  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0271378 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2697  FeoA family protein  40.28 
 
 
76 aa  54.7  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0855124  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0541  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.67 
 
 
207 aa  54.7  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000508383  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0097  iron dependent repressor, putative  39.44 
 
 
238 aa  54.7  0.0000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0071213  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1435  hypothetical protein  42.25 
 
 
84 aa  54.7  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000347504  normal  0.0226993 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4261  FeoA family protein  38.36 
 
 
84 aa  53.9  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.609569  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4104  FeoA family protein  48.98 
 
 
77 aa  53.9  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.418864  normal  0.543833 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2465  FeoA family protein  40.54 
 
 
94 aa  53.9  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3984  ferrous iron transport protein A  44.44 
 
 
75 aa  53.9  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3745  ferrous iron transport protein A  44.44 
 
 
75 aa  53.9  0.0000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0169  ferrous iron transport protein A  44.44 
 
 
75 aa  53.9  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2257  ferrous iron transport protein FeoA  33.82 
 
 
75 aa  53.5  0.0000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0965  FeoA family protein  30.14 
 
 
152 aa  53.5  0.0000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1912  putative ferrous iron transport protein  41.1 
 
 
81 aa  53.1  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00246631  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1630  feoA protein  41.1 
 
 
83 aa  53.1  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000000794157  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2844  FeoA family protein  40.54 
 
 
88 aa  53.1  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0619  hypothetical protein  34.72 
 
 
73 aa  53.1  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000301048  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3367  FeoA family protein  38.89 
 
 
77 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2435  FeoA family protein  38.89 
 
 
95 aa  53.1  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0433  FeoA family protein  41.07 
 
 
143 aa  52.4  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56690  ferrous iron transport protein A  32.39 
 
 
75 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1730  FeoA family protein  36.99 
 
 
75 aa  52.8  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000285273  normal  0.0385083 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1459  FeoA family protein  35.14 
 
 
75 aa  52.8  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0291796  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1953  FeoA family protein  38.89 
 
 
80 aa  52.8  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000394964  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3411  FeoA family protein  38.89 
 
 
77 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1930  ferrous iron transport protein A  37.33 
 
 
74 aa  52  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000000000534516  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13000  Fe2+ transport system protein A  44.9 
 
 
73 aa  52  0.000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0312741  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0745  FeoA family protein  34.25 
 
 
79 aa  52  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.445851 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0570  FeoA family protein  41.51 
 
 
78 aa  51.6  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.157552  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4930  ferrous iron transport protein A  35.48 
 
 
75 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1971  FeoA family protein  35.82 
 
 
86 aa  50.8  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0237641  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0343  FeoA family protein  34.67 
 
 
78 aa  50.8  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0183501  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3725  ferrous iron transport protein A  36.62 
 
 
78 aa  50.4  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0974  FeoA family protein  50 
 
 
106 aa  50.1  0.000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0128498  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2064  ferrous iron transport protein A  36.49 
 
 
74 aa  49.7  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000130749  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0109  FeoA family protein  36.62 
 
 
90 aa  50.1  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000157937  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3292  hypothetical protein  46.94 
 
 
77 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.27216  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3837  FeoA family protein  34.25 
 
 
86 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0653  Fe2+ transport system protein A  39.13 
 
 
158 aa  48.9  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1665  ferrous iron transport protein A  31.08 
 
 
76 aa  48.9  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16120  ferrous iron transporter FeoB  36.99 
 
 
785 aa  49.7  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000453744 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2276  FeoA family protein  35.62 
 
 
84 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1554  FeoA family protein  37.14 
 
 
74 aa  48.9  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000033207  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4235  FeoA family protein  44.68 
 
 
74 aa  48.5  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.679143  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2691  FeoA family protein  34.62 
 
 
79 aa  48.1  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.537958  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0292  ferrous iron transport protein B  33.82 
 
 
784 aa  48.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000454012  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01363  hypothetical protein  35.85 
 
 
75 aa  47.8  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3828  FeoA family protein  35.62 
 
 
71 aa  47.8  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.902982 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0857  hypothetical protein  40 
 
 
81 aa  47.4  0.00006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.577958  normal  0.227068 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0719  ferrous iron transport protein B  38.89 
 
 
829 aa  47.4  0.00006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0311256  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0552  FeoA family protein  39.29 
 
 
84 aa  47.4  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>