165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0452 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0452  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  100 
 
 
251 aa  515  1.0000000000000001e-145  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2687  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  54.62 
 
 
251 aa  288  5.0000000000000004e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00343965  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3624  CoA-substrate-specific enzyme activase  50.74 
 
 
275 aa  270  1e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000071885  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0544  CoA enzyme activase  52.4 
 
 
263 aa  260  2e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4398  CoA-substrate-specific enzyme activase  49.02 
 
 
266 aa  259  4e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000662171  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3104  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  50 
 
 
256 aa  258  8e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2727  (R)-2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase activator, putative  48.25 
 
 
260 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0484  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  52.63 
 
 
256 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0386  CoA-substrate-specific enzyme activase  50.2 
 
 
256 aa  242  3.9999999999999997e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0392  CoA-substrate-specific enzyme activase  50.2 
 
 
256 aa  242  3.9999999999999997e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2926  (R)-2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase activator, putative  50.6 
 
 
253 aa  241  7e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1417  CoA enzyme activase  35.83 
 
 
260 aa  150  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000376879  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1706  CoA-substrate-specific enzyme activase  36.61 
 
 
262 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1310  CoA-substrate-specific enzyme activase  34.68 
 
 
253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1326  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  30.04 
 
 
242 aa  137  1e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0887236  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25420  CoA-substrate-specific enzyme activase, putative  34.82 
 
 
248 aa  137  2e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000315208  normal  0.628914 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1358  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  30.95 
 
 
244 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.512731  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2520  (R)-2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase activator  34.66 
 
 
253 aa  132  5e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.491002  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0864  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  36.61 
 
 
249 aa  132  6.999999999999999e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224978  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16070  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  32.43 
 
 
260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1349  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  30.65 
 
 
242 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00045569 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0387  (R)-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase activator  33.47 
 
 
249 aa  129  6e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000890821  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1005  CoA enzyme activase  34.48 
 
 
255 aa  128  7.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.350991  hitchhiker  0.000148209 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0428  (R)-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase activator  33.74 
 
 
256 aa  127  1.0000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.215923  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0200  CoA-substrate-specific enzyme activase  31.75 
 
 
539 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000427749  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1148  CoA-substrate-specific enzyme activase  33.85 
 
 
268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15664  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2039  CoA-substrate-specific enzyme activase  33.47 
 
 
256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0546  CoA-substrate-specific enzyme activase  34.26 
 
 
263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0604  CoA-substrate-specific enzyme activase  30 
 
 
246 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1099  CoA-substrate-specific enzyme activase  35.22 
 
 
264 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0705  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  35.32 
 
 
269 aa  125  5e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.455724 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0987  CoA-substrate-specific enzyme activase  35.25 
 
 
269 aa  124  1e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.429759 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1277  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  35.16 
 
 
259 aa  124  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1347  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  31.64 
 
 
246 aa  124  1e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0411  CoA enzyme activase  32.3 
 
 
258 aa  124  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.882889  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1745  CoA-substrate-specific enzyme activase  35.03 
 
 
261 aa  124  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1468  CoA-substrate-specific enzyme activase  35.1 
 
 
256 aa  123  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3160  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  32.81 
 
 
267 aa  122  5e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0090  CoA-substrate-specific enzyme activase  32.03 
 
 
253 aa  121  8e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2945  (R)-2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase activator, putative  34.63 
 
 
248 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2057  CoA enzyme activase  30.77 
 
 
256 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.712882 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11310  CoA-substrate-specific enzyme activase, putative  30.77 
 
 
247 aa  121  9.999999999999999e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.45767 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0874  (R)-2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase activator (2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase component A)  31.47 
 
 
259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1279  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  33.9 
 
 
255 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0089  CoA enzyme activase  31.06 
 
 
259 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2023  CoA-substrate-specific enzyme activase  31.75 
 
 
251 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.124243  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3911  CoA-substrate-specific enzyme activase  31.5 
 
 
264 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1773  CoA-substrate-specific enzyme activase  29.69 
 
 
263 aa  116  3.9999999999999997e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.912116  normal  0.454124 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0885  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  31.37 
 
 
259 aa  115  6e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.71068  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1928  CoA-substrate-specific enzyme activase  30.68 
 
 
258 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3452  CoA-substrate-specific enzyme activase  31.78 
 
 
261 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2399  CoA-substrate-specific enzyme activase  36.04 
 
 
272 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2772  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  31.6 
 
 
260 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2771  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  30.77 
 
 
267 aa  113  3e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0829  CoA-substrate-specific enzyme activase  32.28 
 
 
254 aa  112  5e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000428387 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0893  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  30.53 
 
 
273 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0272  CoA enzyme activase  31.66 
 
 
268 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.727827  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3879  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  29.18 
 
 
269 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1898  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  31.05 
 
 
539 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1693  CoA-substrate-specific enzyme activase  31.87 
 
 
250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1133  putative CoA-substrate-specific enzyme activase, putative  29.92 
 
 
259 aa  109  4.0000000000000004e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000196227  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0118  CoA-substrate-specific enzyme activase  30.71 
 
 
267 aa  109  5e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00112536  hitchhiker  0.00758509 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4562  (R)-2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase activator  33.2 
 
 
255 aa  107  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3729  CoA-substrate-specific enzyme activase  33.2 
 
 
255 aa  107  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.367049  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4770  (R)-2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase activator  33.2 
 
 
255 aa  107  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4881  (R)-2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase activator  33.2 
 
 
255 aa  106  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.705619  normal  0.786718 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0253  CoA-substrate-specific enzyme activase  35 
 
 
244 aa  106  4e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1412  CoA-substrate-specific enzyme activase  32.55 
 
 
272 aa  105  6e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4936  (R)-2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase activator  33.2 
 
 
255 aa  105  6e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0619  CoA-substrate-specific enzyme activase  30.94 
 
 
359 aa  105  8e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2868  CoA-substrate-specific enzyme activase  30.74 
 
 
272 aa  104  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04203  predicted ATPase, activator of (R)-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase  32.81 
 
 
255 aa  103  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0419339  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04166  hypothetical protein  32.81 
 
 
255 aa  103  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0259899  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2776  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  29.34 
 
 
272 aa  103  4e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3661  CoA-substrate-specific enzyme activase  32.81 
 
 
255 aa  102  5e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0497003  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3161  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  31.92 
 
 
275 aa  102  5e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0040907  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5848  (R)-2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase activator  31.87 
 
 
255 aa  101  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0786  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  30.43 
 
 
274 aa  99.4  4e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.260383  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1370  CoA enzyme activase  30.71 
 
 
319 aa  96.7  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1027  benzoyl-CoA reductase, subunit A  32.6 
 
 
437 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.817677  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2949  benzoyl-CoA reductase, subunit A  33 
 
 
438 aa  94.7  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1536  benzoyl-CoA reductase, subunit A  32.89 
 
 
437 aa  93.2  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1215  CoA-substrate-specific enzyme activase, putative  29.01 
 
 
975 aa  92.8  4e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0726  benzoyl-CoA reductase, subunit A  32.08 
 
 
437 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.810305  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1406  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  28.9 
 
 
975 aa  91.3  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.25548  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0551  NADPH-dependent F420 reductase  30.59 
 
 
420 aa  90.9  2e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.134665 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1539  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  27.97 
 
 
1036 aa  89  7e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1123  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  31.2 
 
 
327 aa  87.8  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1685  CoA-substrate-specific enzyme activase  31.8 
 
 
255 aa  86.7  3e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.820549 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07110  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  31.6 
 
 
331 aa  86.3  5e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0544  BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family protein  28.35 
 
 
283 aa  85.9  6e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0251  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  28.63 
 
 
320 aa  85.9  6e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.013721  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_485  BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase  28.35 
 
 
283 aa  85.9  6e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2061  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  29.73 
 
 
412 aa  85.5  7e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3433  CoA-substrate-specific enzyme activase  29.69 
 
 
344 aa  85.5  8e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03240  CoA-substrate-specific enzyme activase, putative  30.37 
 
 
1500 aa  84.7  0.000000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.34888  normal  0.458746 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2218  CoA-substrate-specific enzyme activase  28.79 
 
 
323 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2307  CoA enzyme activase  29.64 
 
 
413 aa  84  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1906  CoA enzyme activase  29.46 
 
 
414 aa  82.4  0.000000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.213547  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1977  CoA-substrate-specific enzyme activase  27.97 
 
 
339 aa  82  0.000000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>